A família de retrotransposons TNT1 de Solanaceae: evolução, diversificação e função

• Processo: 08/55646-4
• Modalidade de apoio: Auxílio à Pesquisa - Regular
• Data de Início da vigência: 01 de fevereiro de 2009
• Data de Término da vigência: 31 de julho de 2011
• Área do conhecimento: Ciências Biológicas - Genética - Genética Molecular e de Microorganismos
• Acordo de Cooperação: INRA
• Pesquisador responsável: Marie-Anne Van Sluys
• Beneficiário: Marie-Anne Van Sluys
• Pesquisador Responsável no exterior: Marie-Angèle Grandbastien
• Instituição Parceira no exterior: Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), França
• Instituição Sede: Instituto de Biociências (IB). Universidade de São Paulo (USP). São Paulo , SP, Brasil
• Assunto(s): Genética molecular vegetal Solanaceae Retroelementos Expressão gênica Interferência de RNA Regulação da expressão gênica
• Palavra(s)-Chave do Pesquisador: Controle De Expressao | Expressao Global | Familia Tnt1 | Redes Regulatorias | Retrotransposon | Solanaceae

Resumo

Os retrotransposons, elementos de transposição que se amplificam através de um intermediário RNA, compõem mais de 60% de certos genomas vegetais e são geralmente ativados pelo estresse. Essa ativação poderia ter um impacto sobre a expressão dos genes celulares e estarem associados a resposta do hospedeiro a certos estímulos. O objetivo de base deste projeto FAPESP - INRA é o de avaliar a relação entre a expressão e a diversificação funcional dos retrotransposons da família Tntl, presentes em Solanaceae (tabaco, tomate, batata). Este projeto é a associação de dois parceiros (INRA - Versailles e GaTE-IBUSP) que colaboram há muitos anos na análise dos retrotransposons da família Tntl e nossa abordagem será baseada na utilização de ferramentas inovadoras como a análise por micro arranjos de c DNA de Tabaco elaborados a partir de material em diferentes fases de desenvolvimento e material cuja expressão de Tntl foi desativada por interferência de RNA. Este projeto representa uma abordagem nova e original nos interesses de pesquisa atuais das 2 instituições solicitantes e os resultados permitirão obter uma imagem global do conjunto do genoma referente à participação dos retrotransposons nas vias de regulação gênica em plantas. (AU)

Publicações científicas

(Referências obtidas automaticamente do Web of Science e do SciELO, por meio da informação sobre o financiamento pela FAPESP e o número do processo correspondente, incluída na publicação pelos autores)

MANETTI, M. E.; ROSSI, M.; NAKABASHI, M.; GRANDBASTIEN, M. A.; VAN SLUYS, MARIE ANNE. The Tnt1 family member Retrosol copy number and structure disclose retrotransposon diversification in different Solanum species. Molecular Genetics and Genomics, v. 281, n. 3, p. 261-271, Mar. 2009. (08/55646-4)