Desenho racional de peptídeos inibidores específicos para proteínas cinase C: uma abordagem computacional e validação experimental

• Processo: 08/52695-4
• Modalidade de apoio: Auxílio à Pesquisa - Regular
• Data de Início da vigência: 01 de outubro de 2008
• Data de Término da vigência: 30 de setembro de 2010
• Área do conhecimento: Ciências Biológicas - Bioquímica - Química de Macromoléculas
• Pesquisador responsável: Paulo Sergio Lopes de Oliveira
• Beneficiário: Paulo Sergio Lopes de Oliveira
• Instituição Sede: Instituto do Coração Professor Euryclides de Jesus Zerbini (INCOR). Hospital das Clínicas da Faculdade de Medicina da USP (HCFMUSP). Secretaria da Saúde (São Paulo - Estado). São Paulo , SP, Brasil
• Assunto(s): Modelagem molecular Proteína quinase C
• Palavra(s)-Chave do Pesquisador: Bioinformatica | Estrutura De Proteinas | Modelagem Molecular | Proteina Cinase C

Resumo

As proteínas cinase possuem um papel importante na sinalização celular coordenando vários processos celulares, incluindo: metabolismo, crescimento, divisão, diferenciação, mobilidade, transporte através de membranas, contração, e apoptose. Alterações nas proteínas-cinase acarretam um grande número de doenças como inflamações, doenças auto-imune, cânceres e patologias cardíacas. As proteínas cinase são alvos atrativos para o desenvolvimento de novos fármacos, inclusive estima-se que 25% dos esforços da indústria farmacêutica são concentrados no desenvolvimento de inibidores para as cinases. Porém, há dificuldades em encontrar moduladores específicos para as diferentes cinases visto que são muito semelhantes. A utilização de pequenas moléculas como fármacos muitas vezes não apresentam especificidade suficiente para atuar em uma única cinase, causando efeitos colaterais indesejados. A busca e utilização de peptídeos para estudos de cinase já é realizada há muito tempo, mas poucos inibidores específicos a uma única cinase foram encontrados. No presente projeto é proposto o desenvolvimento de um método computacional para seleção de peptídeos candidatos a inibidores específicos de determinadas cinases. Utilizaremos informações da literatura e de estruturas cristalográficas de proteínas cinases, criaremos complexos proteína-peptídeo por meio de modelagem molecular. Estes complexos são submetidos a métodos de mecânica molecular e cálculos de energia de ligação utilizando o método de Poisson-Boltzmann. Após estas etapas selecionaremos peptídeos com maior especificidade para uma cinase especifica. Esse estudo terá uma abordagem multidisciplinar sendo desenvolvido no Instituto do Coração - INCOR - USP, com a colaboração de Dra. Deborah Schechtman, onde será possível validar experimentalmente o método desenvolvido utilizado proteínas cinase relacionadas a patologias cardíacas. (AU)