SMOLBNet 2.0: Biologia de Sistemas aplicada ao estudo das redes de interação das cinases Nek 1,4,6-9 e 11 e ao desenvolvimento de novos inibidores

• Processo: 10/17842-6
• Modalidade de apoio: Bolsas no Brasil - Pós-Doutorado
• Data de Início da vigência: 01 de abril de 2011
• Data de Término da vigência: 31 de dezembro de 2012
• Área de conhecimento: Ciências Biológicas - Bioquímica - Biologia Molecular
• Pesquisador responsável: Jörg Kobarg
• Beneficiário: Gabriela Vaz Meirelles
• Instituição Sede: Associação Brasileira de Tecnologia de Luz Síncrotron (ABTLuS). Ministério da Ciência, Tecnologia e Inovação (Brasil). Campinas , SP, Brasil
• Bolsa(s) vinculada(s): 12/05092-8 - Modelagem e análise das redes de interações das NEKs, incluindo potenciais inibidores, BE.EP.PD
• Assunto(s): Neoplasias Inibidores Estrutura e função de proteínas Ciclo celular
• Palavra(s)-Chave do Pesquisador: câncer | ciclo celular | cinases | inibidores | onco proteína | estrutura e função de proteínas

Resumo

Cinases são proteínas reguladoras envolvidas em praticamente todos os aspectos funcionais das células, principalmente em vias de sinalização. O genoma humano codifica aproximadamente 518 proteínas cinases (2% do genoma humano) e, dentre as muitas cinases descritas, aquelas que atuam na regulação do ciclo celular têm sido consideradas, atualmente, os mais promissores alvos terapêuticos anti-câncer. A progressão da mitose e a montagem do fuso mitótico são reguladas por várias serina/treonina cinases, incluindo membros da família relacionada à NIMA (Neks: NIMA-related kinases), sendo os menos estudados e caracterizados funcionalmente. Os mamíferos apresentam uma extensa família de 11 Neks estruturalmente homólogas à NIMA, regulador mitótico indispensável em Aspergillus nidulans, as quais têm sido descritas como super-expressas em tumores ou como alvos de mutações em câncer. Este projeto tem como foco os estudos relacionados à função e estrutura das Neks 1, 4, 6-9 e 11 humanas, no contexto de uma Biologia de Sistemas (Systems Biology) aplicada, visando o desenvolvimento de modelos in silico para análise das redes de interação das Neks e de possíveis inibidores com potencial para testes pré-clínicos e clínicos. Realizaremos bioensaios in vitro e in vivo em larga escala, utilizando inibidores a partir de bibliotecas de compostos de origem diversa (comerciais, sintéticos e produtos naturais), além da implementação de uma plataforma de bioinformática e desenvolvimento de ferramentas computacionais fundamentais para integrar um extenso volume de dados (gerado a partir de ensaios de duplo-híbrido, imunoprecipitação de complexos e espectrometria de massa, microarranjo, high content screening, etc.), em modelos de redes regulatórias e de comportamento celular, que facilitem a validação de alvos terapêuticos e desenho de drogas.