Programa Genoma Xanthomonas axonopodis pv citri - laboratório de sequenciamento

• Processo: 99/06747-1
• Modalidade de apoio: Auxílio à Pesquisa - Programa GENOMA
• Data de Início da vigência: 01 de setembro de 1999
• Data de Término da vigência: 30 de junho de 2002
• Área do conhecimento: Ciências Biológicas - Bioquímica - Biologia Molecular
• Pesquisador responsável: Alda Maria Backx Noronha Madeira
• Beneficiário: Alda Maria Backx Noronha Madeira
• Instituição Sede: Faculdade de Medicina Veterinária e Zootecnia (FMVZ). Universidade de São Paulo (USP). São Paulo , SP, Brasil
• Assunto(s): Análise de sequência de DNA Laboratórios Genoma Xanthomonas

Resumo

A biotecnologia é hoje uma área de pesquisa estratégica para o desenvolvimento do Brasil. Ampliar a capacitação nacional, nessa área, tornou-se necessidade urgente para que o país possa responder aos novos desafios e oportunidades de pesquisa, de desenvolvimento científico e tecnológico e de competitividade, em muitos setores da economia. O fortalecimento imediato da Biotecnologia Vegetal, em particular, mostra-se tático e crucial para que o país domine as tecnologias que vão capacitá-lo a entrar no ambiente de competição global das áreas da Biotecnologia ligadas à indústria farmacêutica e à microeletrônica. Desta forma, projetos Genoma como este, podem contribuir sobremaneira para o desenvolvimento da biotecnologia brasileira. Este projeto propõe o completo sequenciamento genético do micro-organismo Xanthomonas axonopodis pv citri, bactéria patogênica, causadora do cancro cítrico. Apesar de ser o maior produtor mundial, o Brasil tem uma fraca participação no mercado de exportação de frutas frescas devido às doenças infecciosas em suas plantações. Este projeto gerará um conhecimento que pode levar à compreensão de mecanismos envolvidos no processo infeccioso possibilitando evidenciar variabilidades genéticas determinantes de graus de virulência e desenvolvimento de drogas para o tratamento eficaz e bloqueio da proliferação do cancro cítrico. O tamanho aproximado do genoma da X. citri é de 5 milhões de bases. O microorganismo X. citri é tecnicamente adequado às finalidades do projeto e seu sequenciamento, além da importância científica, tem incontestável relevância econômica e social. O laboratório de Biologia Molecular da Faculdade de Medicina Veterinária e Zootecnia da USP inicialmente se responsabilizou pelo sequenciamento de no mínimo 3.000 leituras contendo pelo menos 400 bases com qualidade superior a 20 (de acordo com o programa phred), pelo sequenciamento de pelo menos 6 cosmídeos por ano e a anotação de genes. (AU)