FORESTs: Eucalyptus Genome Sequencing Project Consortium

• Processo: 01/10251-3
• Modalidade de apoio: Auxílio à Pesquisa - Parceria para Inovação Tecnológica - PITE
• Data de Início da vigência: 01 de novembro de 2001
• Data de Término da vigência: 31 de outubro de 2004
• Área do conhecimento: Ciências Agrárias - Recursos Florestais e Engenharia Florestal - Silvicultura
• Pesquisador responsável: Helaine Carrer
• Beneficiário: Helaine Carrer
• Instituição Sede: Escola Superior de Agricultura Luiz de Queiroz (ESALQ). Universidade de São Paulo (USP). Piracicaba , SP, Brasil
• Empresa: Consórcio de Empresas Florestais de Papel e Celulose
• Município: Piracicaba
• Assunto(s): Biologia computacional Genômica Análise de sequência de DNA Eucalipto
• Palavra(s)-Chave do Pesquisador: Bioinformatica | Blast | Construcao De Bibliotecas | Eucalyptus Sp | Genomica | Sequenciamento De Dna

Resumo

O projeto Genoma Eucalipto visou identificar 15 mil genes por meio do sequenciamento de aproximadamente 100 mil ESTs (Expressed Sequence Tags), preparadas a partir de bibliotecas de diferentes tecidos, incluindo plântulas, folhas, raízes, caule e madeira. As sequências de ESTs foram anotadas automaticamente e clusterizadas para a identificação dos genes. Por meio do uso de tecnologias de bioinformática, o projeto realizou a análise dessas sequências, observando a redundância durante o sequenciamento; a comparação (Blast) das sequências com as depositadas em bancos de dados internacionais e do programa Genoma FAPESP; e a clusterização das sequências obtidas por programas especiais de análise de dados, como CAP3 e outros. Adicionalmente, pretendeu-se usar as informações obtidas para realizar a análise da expressão gênica usando os microarrays. Com isso, buscou-se desenvolver uma nova tecnologia de identificação de genes envolvidos no controle genético da qualidade da madeira e na resistência a doenças e pragas, estresses ambientais e tolerância a deficiências nutricionais. A intenção era que essas informações fossem disponibilizadas rapidamente às empresas para modificação das propriedades da madeira no uso industrial ou em outras aplicações. (AU)