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Genômica funcional aplicada à descoberta de genes de resistência à ferrugem do eucalipto

Processo: 08/50361-1
Linha de fomento:Auxílio à Pesquisa - Parceria para Inovação Tecnológica - PITE
Vigência: 01 de junho de 2010 - 31 de maio de 2013
Área do conhecimento:Ciências Agrárias - Recursos Florestais e Engenharia Florestal - Silvicultura
Pesquisador responsável:Carlos Alberto Labate
Beneficiário:Carlos Alberto Labate
Instituição-sede: Escola Superior de Agricultura Luiz de Queiroz (ESALQ). Universidade de São Paulo (USP). Piracicaba, SP, Brasil
Empresa: Suzano Papel e Celulose S/A
Assunto(s):Eucalipto  Ferrugem (doença de planta)  Genética vegetal  Genômica  Proteômica  Biotecnologia 

Resumo

O objetivo do projeto de inovação tecnológica é o desenvolvimento de uma plataforma de tecnologia genômica, baseada na análise do transcritoma (utilizando as tecnologias SAGE e Microarrays) e proteoma de folhas de Eucalyptus grandis, para a descoberta de genes e marcadores de resistência à ferrugem causada por Puccinia psiidi Winter. A descoberta desses genes servirá para a produção de árvores transgênicas de clones e progênies comerciais de Eucalyptus grandis, que apresentam susceptibilidade à doença, bem como no desenvolvimento de marcadores moleculares para a seleção assistida de árvores resistentes à ferrugem. Para tanto, utilizaremos várias populações e clones do programa de melhoramento genético da Suzano Papel e Celulose, que apresentam resistência e susceptibilidade à ferrugem. A partir da análise da expressão gênica e de proteínas será possível identificar genes que conferem resistência à ferrugem. O projeto baseia-se nos resultados preliminares que obtivemos em estudo piloto utilizando a tecnologia SAGE e que possibilitaram a identificação de cerca de 471 genes diferencialmente expressos entre árvores resistentes e susceptíveis à ferrugem. Dentre esses genes, foram identificadas 30 sequências cujas funções são desconhecidas, e que se expressam preferencialmente ou apenas nas árvores resistentes. Esses resultados preliminares indicaram o enorme potencial de aplicação das técnicas de genômica funcional para a identificação de genes de resistência à ferrugem e seleção de árvores mais produtivas. (AU)

Matéria(s) publicada(s) na Revista Pesquisa FAPESP sobre o auxílio:
Mais celulose por centímetro quadrado 

Publicações científicas (5)
(Referências obtidas automaticamente do Web of Science e do SciELO, por meio da informação sobre o financiamento pela FAPESP e o número do processo correspondente, incluída na publicação pelos autores)
BINI, ANDRESSA PERES; QUECINE, MARIA CAROLINA; DA SILVA, THALITA MORAES; SILVA, LUCIANA DUQUE; LABATE, CARLOS ALBERTO. Development of a quantitative real-time PCR assay using SYBR Green for early detection and quantification of Austropuccinia psidii in Eucalyptus grandis. European Journal of Plant Pathology, v. 150, n. 3, p. 735-746, MAR 2018. Citações Web of Science: 3.
FRASSON BUDZINSKI, ILARA GABRIELA; MOON, DAVID H.; MOROSINI, JULIA SILVA; LINDEN, PERNILLA; BRAGATTO, JULIANO; MORITZ, THOMAZ; LABATE, CARLOS ALBERTO. Integrated analysis of gene expression from carbon metabolism, proteome and metabolome, reveals altered primary metabolism in Eucalyptus grandis bark, in response to seasonal variation. BMC PLANT BIOLOGY, v. 16, JUL 1 2016. Citações Web of Science: 2.
QUECINE, MARIA CAROLINA; LEITE, THIAGO FALDA; BINI, ANDRESSA PERES; REGIANI, THAIS; FRANCESCHINI, LIVIA MARIA; FRASSON BUDZINSKI, ILARA GABRIELA; MARQUES, FELIPE GARBELINI; VENEZIANO LABATE, MONICA TERESA; GUIDETTI-GONZALEZ, SIMONE; MOON, DAVID HENRY; LABATE, CARLOS ALBERTO. Label-Free Quantitative Proteomic Analysis of Puccinia psidii Uredospores Reveals Differences of Fungal Populations Infecting Eucalyptus and Guava. PLoS One, v. 11, n. 1 JAN 5 2016. Citações Web of Science: 4.
QUECINE, MARIA CAROLINA; BINI, ANDRESSA PERES; ROMAGNOLI, EMILIANA R.; ANDREOTE, FERNANDO DINI; MOON, DAVID HENRY; LABATE, CARLOS ALBERTO. Genetic Variability in Puccinia psidii Populations as Revealed by PCR-DGGE and T-RFLP Markers. PLANT DISEASE, v. 98, n. 1, p. 16-23, JAN 2014. Citações Web of Science: 5.
LEITE, THIAGO FALDA; MOON, DAVID HENRY; MUDAD LIMA, ANA CAROLINA; LABATE, CARLOS ALBERTO; OSSAMU TANAKA, FRANCISCO ANDRE. A simple protocol for whole leaf preparation to investigate the interaction between Puccinia psidii and Eucalyptus grandis. AUSTRALASIAN PLANT PATHOLOGY, v. 42, n. 1, p. 79-84, 2013. Citações Web of Science: 2.

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