Estudos funcionais e estruturais de três proteínas humanas reguladoras: Fez1, Ki-1/57 e NSAP1 (hnRNP-Q)

• Processo: 05/00235-1
• Modalidade de apoio: Auxílio à Pesquisa - Regular
• Data de Início da vigência: 01 de agosto de 2005
• Data de Término da vigência: 31 de outubro de 2007
• Área do conhecimento: Ciências Biológicas - Bioquímica
• Pesquisador responsável: Jörg Kobarg
• Beneficiário: Jörg Kobarg
• Instituição Sede: Associação Brasileira de Tecnologia de Luz Síncrotron (ABTLuS). Ministério da Ciência, Tecnologia e Inovação (Brasil). Campinas , SP, Brasil
• Assunto(s): Proteínas oncogênicas Redes reguladoras de genes Interferência de RNA Espectrometria de massas
• Palavra(s)-Chave do Pesquisador: Funcao E Estrutra De Proteinas | Interacao De Proteinas | Mecanismos De Sinalizacao | Onco Proteina | Traducao De Sinal | função e estrutura de proteínas

Resumo

Pretendemos estudar a função e estrutura de três proteínas humanas reguladoras envolvidas em doenças. Da proteína NSAP1 (=hnRNP-Q) sabe-se já que ela é uma proteína ligadora ao RNA e possivelmente envolvida no processo de splicing ou na degradação de mRNAs que codificam onco-proteínas. Estruturalmente á proteína não foi estudada mas sabe-se que ela é composta de um domínio ácido, 3 domínios RRM (que ligam RNA) e um domínio RG-box, que é alvo de metilação em argininas. As funções e as estruturas das outras duas proteínas Ki-1/57 e Fez1 ainda não são conhecidas. Através de estudos feitos anteriormente no nosso grupo identificamos várias proteínas envolvidas em processos de sinalização e da regulação da transcrição que interagem com Fez1 ou Ki-1/57. Isso pode sugerir que as duas proteínas são envolvidas neste contexto celular, embora a associação á outras funções ainda é possível. Neste projeto pretendemos estudar a estrutura dessas proteínas ou de seu domínios através de métodos espectroscópicos e de cristalografia. Ainda estudaremos suas funções usando várias técnicas modernas de biologia molecular, incluindo entre outras: silenciamento gênico - (método de iRNA), identificação de modificações pós-traducionais (espectrometria de massa), identificação de proteínas que interagem in vitro (sistem duplo híbrido em levedura) e in vivo (espectrometria de massa), SELEX (Systematic Evolution of Ligands by eXponential Enrichment). (AU)

Publicações científicas

(5)

(Referências obtidas automaticamente do Web of Science e do SciELO, por meio da informação sobre o financiamento pela FAPESP e o número do processo correspondente, incluída na publicação pelos autores)

LANZA‚ D.C.F.; TRINDADE‚ D.M.; ASSMANN‚ E.M.; KOBARG‚ J.. Over-expression of GFP-FEZ1 causes generation of multi-lobulated nuclei mediated by microtubules in HEK293 cells. Experimental Cell Research, v. 314, n. 10, p. 2028-2039, 2008. (05/00235-1)

ASSMANN, ELIANA M.; ALBORGHETTI, MARCOS R.; CAMARGO, MARIA E. R.; KOBARG, JORG. FEZ1 dimerization and interaction with transcription regulatory proteins involves its coiled-coil region. Journal of Biological Chemistry, v. 281, n. 15, p. 9869-9881, Apr. 2006. (05/00235-1)

LANZA, DANIEL C. F.; SILVA, JULIO C.; ASSMANN, ELIANA M.; QUARESMA, ALEXANDRE J. C.; BRESSAN, GUSTAVO C.; TORRIANI, IRIS L.; KOBARG, JOERG. Human FEZ1 has characteristics of a natively unfolded protein and dimerizes in solution. PROTEINS-STRUCTURE FUNCTION AND BIOINFORMATICS, v. 74, n. 1, p. 104-121, JAN 2009. (05/00235-1)

QUARESMA, ALEXANDRE J. C.; BRESSAN, G. C.; GAVA, L. M.; LANZA, D. C. F.; RAMOS, C. H. I.; KOBARG, JOERG. Human hnRNP Q re-localizes to cytoplasmic granules upon PMA, thapsigargin, arsenite and heat-shock treatments. Experimental Cell Research, v. 315, n. 6, p. 968-980, APR 1 2009. (05/00235-1)

BRESSAN, GUSTAVO C.; SILVA, JULIO C.; BORGES, JULIO C.; DOS PASSOS, DARIO O.; RAMOS, CARLOS H. I.; TORRIANI, IRIS L.; KOBARG, JOERG. Human regulatory protein Ki-1/57 has characteristics of an intrinsically unstructured protein. JOURNAL OF PROTEOME RESEARCH, v. 7, n. 10, p. 4465-4474, OCT 2008. (05/00235-1)