Diversidade viral nos níveis Inter e Intra-hospedeiro estimada durante um grande surto de DENV2.

• Processo: 13/18600-4
• Modalidade de apoio: Auxílio à Pesquisa - Publicações científicas - Artigo
• Data de Início da vigência: 01 de outubro de 2013
• Data de Término da vigência: 31 de março de 2014
• Área do conhecimento: Ciências Biológicas - Genética - Genética Molecular e de Microorganismos
• Pesquisador responsável: Camila Malta Romano
• Beneficiário: Camila Malta Romano
• Instituição Sede: Instituto de Medicina Tropical de São Paulo (IMT). Universidade de São Paulo (USP). São Paulo , SP, Brasil
• Assunto(s): Diversidade genética Variabilidade Virologia
• Palavra(s)-Chave do Pesquisador: dengue 2 | Diversidade Genética | inter-população | intra-hospedeiro | Variabilidade | Virologia

Resumo

Background: A alta diversidade genética, tanto a nível inter-e intra-hospedeiro são características de vírus de RNA, devido à natureza da sua replicação do genoma. Vários grupos têm avaliado o grau de variabilidade do vírus de RNA usando diferentesmétodos de sequenciamento em larga escala. Embora grande parte desse esforço tenha sido dedicado aos patógenos que causam infecções crônicas emseres humanos, poucos estudos investigaram infecções virais agudas transmitidas por artrópodes.Métodos e resultados principais: Sequenciamos em larga escala o genoma completo de dez isolados de DENV2 representando casos clássicos e graves amostrados em um grande surto no Brasil, utilizando duas abordagens diferentes. A análise dos genomas consenso confirmou a maior extensão que chegou a epidemia de 2010, em comparação com a epidemia anterior causada pelo mesmavírus em outra cidade dois anos antes (distância genética = 0,002 e 0,0008, respectivamente). Análise de populações viraisintra- hospedeiro revelou um elevado grau de conservação. Após a exclusão de regiões de homopolímero dos genomas gerados pelo 454/Roche, encontramos 10-44 sítios variáveis por população viral em uma freqüência de 0,1%, resultando em uma diversidade genética muito baixa no nivel intra-hospedeiro. Embora até 60% de todos os sitios variáveis a nível intra-hospedeiro foram mudanças não-sinônimas, apenas 10% destes resultou em mutações não sinônimas inter hospedeiros, indicando seleção purificadora ao nível da população.Conclusões e Significado: Apesar da natureza da RNA-polimerase RNA dependente, que não corrige erros provenientes da polimerisação, os vírus da dengue mantem baixos níveis de variabilidade intra-hospedeiro. (AU)