Structure and dynamics of proteins by high-resolution NMR spectroscopy, SAXS, and computation

• Processo: 13/50355-0
• Modalidade de apoio: Auxílio à Pesquisa - Regular
• Data de Início da vigência: 01 de outubro de 2013
• Data de Término da vigência: 30 de setembro de 2014
• Área do conhecimento: Ciências Biológicas - Biofísica - Biofísica Molecular
• Acordo de Cooperação: Ohio State University
• Pesquisador responsável: Roberto Kopke Salinas
• Beneficiário: Roberto Kopke Salinas
• Pesquisador Responsável no exterior: Mark Foster
• Instituição Parceira no exterior: Ohio State University, Columbus, Estados Unidos
• Instituição Sede: Instituto de Química (IQ). Universidade de São Paulo (USP). São Paulo , SP, Brasil
• Vinculado ao auxílio: 11/07777-5 - Sinalização por c-di-GMP e o sistema de secreção de macromoléculas do tipo IV em Xanthomonas citri, AP.TEM
• Assunto(s): Simulação de dinâmica molecular Proteínas Espectroscopia de ressonância magnética nuclear Espalhamento de raios X a baixos ângulos
• Palavra(s)-Chave do Pesquisador: Biofisica

Resumo

As propriedades dinâmicas de muitas proteínas são essenciais para a função. Apesar disto, pouco compreendemos sobre dinâmica de proteínas, ou seja, sobre as flutuações temporais da estrutura molecular. Dinâmica de proteínas desempenha um papel crítico em diversos processos celulares, incluindo metabolismo, regulação gênica e transdução de sinal. O plano de pesquisa proposto tem por objetivo aumentar a nossa compreensão acerca do comportamento dinâmico de proteínas através da combinação de espectroscopia de Ressonância Magnética Nuclear (RMN), simulações computacionais de dinâmica molecular, e espalhamento de luz a baixo ângulo (SAXS). OSU e USP possuem expertise e infra-estrutura complementar para a realização destes estudos. A presente proposta pretende utilizar uma colaboração já existente como ponto de partida para estabelecer uma nova abordagem colaborativa para o estudo de dinâmica de proteínas. (AU)

Publicações científicas

(Referências obtidas automaticamente do Web of Science e do SciELO, por meio da informação sobre o financiamento pela FAPESP e o número do processo correspondente, incluída na publicação pelos autores)

ABIKO, LAYARA AKEMI; VITALE, PHELIPE M.; FAVARO, DENIZE C.; HAUK, PRICILA; LI, DA-WEI; YUAN, JIAQI; BRUSCHWEILER-LI, LEI; SALINAS, ROBERTO K.; BRUSCHWEILER, RAFAEL. Model for the allosteric regulation of the Na+/Ca2+ exchanger NCX. PROTEINS-STRUCTURE FUNCTION AND BIOINFORMATICS, v. 84, n. 5, p. 580-590, MAY 2016. (13/50355-0, 13/17883-2, 11/07777-5)