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Biodiversidade e processos microbianos em ecossistemas aquáticos

Processo: 14/14139-3
Modalidade de apoio:Auxílio à Pesquisa - Jovens Pesquisadores
Vigência: 01 de fevereiro de 2015 - 31 de janeiro de 2019
Área do conhecimento:Ciências Biológicas - Ecologia
Pesquisador responsável:Hugo Miguel Preto de Morais Sarmento
Beneficiário:Hugo Miguel Preto de Morais Sarmento
Instituição Sede: Centro de Ciências Biológicas e da Saúde (CCBS). Universidade Federal de São Carlos (UFSCAR). São Carlos , SP, Brasil
Pesquisadores associados:Armando Augusto Henriques Vieira ; Bianca Trevizan Segovia da Silva ; Flavio Henrique da Silva ; Inessa Lacativa Bagatini ; Josep Maria Gasol Piqué ; Luciano Takeshi Kishi ; Maria da Graça Gama Melão ; Odete Rocha ; Ramiro Logares ; Stefan Bertilsson
Auxílios(s) vinculado(s):16/50494-8 - Flow cytometry as a tool to assess the impact of mixotrophic Algae in planktonic food webs, AP.R SPRINT
Bolsa(s) vinculada(s):17/26786-1 - Processos estruturantes de comunidades microbianas e redes de interações ecológicas em gradientes latitudinais do oceano global, BP.DR
17/10299-4 - Influência da quantidade e qualidade da matéria orgânica dissolvida (MOD) sobre o metabolismo bacteriano, BP.IC
15/02307-1 - Estudo comparativo de métodos de extração de DNA em microalgas, BP.IC
Assunto(s):Ciclo do carbono  Ecologia microbiana  Limnologia  Metagenômica  Ambiente aquático  Ciclagem de nutrientes 
Palavra(s)-Chave do Pesquisador:Ciclo do Carbono | Diversidade e função microbiana | Ecologia microbiana | interações bióticas | Limnologia | metagenômica | Ecologia microbiana aquática

Resumo

Os ambientes aquáticos têm um papel preponderante na ciclagem da matéria e energia, e geralmente apresentam alta produtividade e biodiversidade. Em regiões tropicais, esses ecossistemas são particularmente relevantes para os ciclos biogeoquímicos. Os microrganismos têm um papel central nos processos de produção e consumo de CO2 nesses ecossistemas. No entanto, pouco se sabe ainda sobre a diversidade filogenética desses microrganismos e suas interações bióticas com outros compartimentos da teia trófica planctônica, assim como os processos que estão por detrás das elevadas emissões de CO2 observadas em ecossistemas aquáticos tropicais. As pesquisas propostas permitirão quantificar estoques de biomassa, processos (e.g. produção, respiração) e forças de interação entre os diferentes compartimentos da teia trófica microbiana planctônica em amostras pontuais a realizar em um grande número de ambientes aquáticos do estado de São Paulo, e ao longo do tempo no reservatório do Broa. Estas coletas de campo, aliadas às pesquisas em ambiente controlado de laboratório (microcosmos) ou experimentos no campo (mesocosmos), permitirão avaliar a influência da estrutura das comunidades de produtores primários e consumidores da cadeia trófica clássica (fitoplâncton, zooplâncton e ictiofauna) nos estoques de biomassa e processos microbianos. Por outro lado, o estudo da biodiversidade de comunidades microbianas planctônicas (procariontes e eucariontes) e a sua dinâmica em relação com os fatores ambientais através de técnicas de sequenciamento de nova geração (sequenciamento de genes marcadores e análise de metagenomas), permitirá obter uma caracterização da estrutura das comunidades e funcionamento ecológico das assembleias microbianas, mas também a obtenção de padrões de co-ocorrência ou de covariância entre microrganismos e outros organismos de diferentes compartimentos da teia alimentar (construção de redes de interação). Esses resultados permitirão testar a robustez de algumas teorias ecológicas (geralmente desenvolvidas para animais e plantas) em sistemas microbianos e esclarecer os mecanismos que estão por trás das elevadas emissões de CO2 observadas em ecossistemas aquáticos tropicais. Esta proposta pretende implementar uma nova linha de pesquisa no DHb da UFSCar, dedicada ao estudo da ecologia e biodiversidade de microrganismos aquáticos, através da aplicação das metodologias mais recentes e tecnologias de ponta tais como a aplicação da citometría de fluxo na quantificação de microrganismos aquáticos e no estudo de propriedades fisiológicas ao nível celular ("single-cell"), técnicas de sequenciamento massivo de nova geração no estudo da biodiversidade de microrganismos aquáticos, entre outras. O objetivo estratégico é criar um grupo de pesquisa que se afirme a nível internacional na fronteira do conhecimento desta área de pesquisa. (AU)

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Publicações científicas (34)
(Referências obtidas automaticamente do Web of Science e do SciELO, por meio da informação sobre o financiamento pela FAPESP e o número do processo correspondente, incluída na publicação pelos autores)
MAIARA MENEZES; PEDRO C. JUNGER; VINICIUS S. KAVAGUTTI; BRUNO WANDERLEY; ANDERSON DE SOUZA CABRAL; RODOLFO PARANHOS; FERNANDO UNREIN; ANDRÉ M. AMADO; HUGO SARMENTO. Temporal patterns of picoplankton abundance and metabolism on the western coast of the equatorial Atlantic Ocean. Ocean and Coastal Research, v. 71, . (16/50494-8, 14/14139-3, 17/26786-1)
DE MELO, MICHAELA L.; BERTILSSON, STEFAN; AMARAL, JOAO HENRIQUE F.; BARBOSA, PEDRO M.; FORSBERG, BRUCE R.; SARMENTO, HUGO. Flood pulse regulation of bacterioplankton community composition in an Amazonian floodplain lake. Freshwater Biology, v. 64, n. 1, p. 108-120, . (14/14139-3)
COSTA, MARIANA R. A.; MENEZES, ROSEMBERG F.; SARMENTO, HUGO; ATTAYDE, JOSE L.; STERNBERG, LEONEL DA S. L.; BECKER, VANESSA. Extreme drought favors potential mixotrophic organisms in tropical semi-arid reservoirs. Hydrobiologia, v. 831, n. 1, SI, p. 43-54, . (16/50494-8, 14/14139-3)
GONSALVES ALHO, LAYS DE OLIVEIRA; GEBARA, RENAN CASTELHANO; PAINA, KARIME DE ARAUJO; SARMENTO, HUGO; GAMA MELDO, MARIA DA GRACA. Responses of Raphidocelis subcapitata exposed to Cd and Pb: Mechanisms of toxicity assessed by multiple endpoints. ECOTOXICOLOGY AND ENVIRONMENTAL SAFETY, v. 169, p. 950-959, . (14/14139-3, 16/00753-7)
AMARAL, JOAO HENRIQUE F.; BORGES, ALBERTO V.; MELACK, JOHN M.; SARMENTO, HUGO; BARBOSA, PEDRO M.; KASPER, DANIELE; DE MELO, MICHAELA L.; DE FEX-WOLF, DANIELA; DA SILVA, JONISMAR S.; FORSBERG, BRUCE R.. Influence of plankton metabolism and mixing depth on CO2 dynamics in an Amazon floodplain lake. Science of The Total Environment, v. 630, p. 1381-1393, . (14/14139-3)
SARMENTO, HUGO; CASAMAYOR, EMILIO O.; AUGUET, JEAN-CHRISTOPHE; VILA-COSTA, MARIA; FELIP, MARISOL; CAMARERO, LLUS; GASOL, JOSEP M.. Microbial food web components, bulk metabolism, and single-cell physiology of piconeuston in surface microlayers of high-altitude lakes. FRONTIERS IN MICROBIOLOGY, v. 6, . (14/14139-3)
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TOYAMA, D.; SANTOS-JUNIOR, C. D.; KISHI, L. T.; OLIVEIRA, T. C. S.; GARCIA, J. W.; SARMENTO, H.; MIRANDA, F. P.; HENRIQUE-SILVA, F.. A snapshot on prokaryotic diversity of the Solimoes River basin (Amazon, Brazil). Genetics and Molecular Research, v. 16, n. 2, . (14/14139-3)
DE LUCCA, GISELE MARIA; FREITAS, EMANUELA CRISTINA; GAMA MELAO, MARIA DA GRACA. Effects of TiO2 Nanoparticles on the Neotropical Cladoceran Ceriodaphnia silvestrii by Waterborne and Dietary Routes. WATER AIR AND SOIL POLLUTION, v. 229, n. 9, . (16/00753-7, 14/14139-3)
SEGOVIA, BIANCA T.; DOMINGUES, CAROLINA D.; MEIRA, BIANCA R.; LANSAC-TOHA, FERNANDO M.; FERMANI, PAULINA; UNREIN, FERNANDO; LOBAO, LUCIA M.; ROLANDO, FABIO; VELHO, LUIZ F. M.; SARMENTO, HUGO. Coupling Between Heterotrophic Nanoflagellates and Bacteria in Fresh Waters: Does Latitude Make a Difference?. FRONTIERS IN MICROBIOLOGY, v. 7, . (14/14139-3)
BARRETO FILHO, MARCELO M.; DURAND, PIERRE M.; ANDOLFATO, NATHAN E.; JORDAAN, ANINE; SARMENTO, HUGO; BAGATINI, INESSA L.. Programmed cell death in the coccoid green microalga Ankistrodesmus densus Korshikov (Sphaeropleales, Selenastraceae). European Journal of Phycology, . (14/14139-3)
FERMANI, PAULINA; METZ, SEBASTIAN; BALAGUE, VANESSA; DESCY, JEAN PIERRE; MORANA, CEDRIC; LOGARES, RAMIRO; MASSANA, RAMON; SARMENTO, HUGO. Microbial eukaryote assemblages and potential novel diversity in four tropical East African Great Lakes. FEMS MICROBIOLOGY ECOLOGY, v. 97, n. 9, . (14/14139-3)
GONCALVES ALHO, LAYS DE OLIVEIRA; SOUZA, JAQUELINE PEROLA; ROCHA, GISELI SWERTS; MANSANO, ADRISLAINE DA SILVA; LOMBARDI, ANA TERESA; SARMENTO, HUGO; GAMA MELAO, MARIADA GRACA. Photosynthetic, morphological and biochemical biomarkers as tools to investigate copper oxide nanoparticle toxicity to a freshwater chlorophyceae. Environmental Pollution, v. 265, n. A, . (18/07988-5, 16/00753-7, 14/14139-3)
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WANDERLEY, BRUNO M. S.; ARAUJO, DANIEL S. A.; QUIROGA, V, MARIA; AMADO, ANDRE M.; NETO, ADRIAO D. D.; SARMENTO, HUGO; METZ, SEBASTIAN D.; UNREIN, FERNANDO. flowDiv: a new pipeline for analyzing flow cytometric diversity. BMC Bioinformatics, v. 20, . (16/50494-8, 14/14139-3)

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