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Desenvolvimento de métodos high-throughput para o estudo de quantitative traits loci relacionados à robustez de leveduras industriais (Saccharomyces cerevisiae)

Processo: 16/02506-7
Linha de fomento:Auxílio à Pesquisa - Programa BIOEN - Regular
Vigência: 01 de setembro de 2016 - 31 de agosto de 2018
Área do conhecimento:Ciências Biológicas - Genética - Genética Molecular e de Microorganismos
Pesquisador responsável:Gleidson Silva Teixeira
Beneficiário:Gleidson Silva Teixeira
Instituição-sede: Instituto de Biologia (IB). Universidade Estadual de Campinas (UNICAMP). Campinas , SP, Brasil
Pesq. associados:Gonçalo Amarante Guimarães Pereira ; Marcelo Falsarella Carazzolle
Bolsa(s) vinculada(s):16/18153-6 - Fenotipagem e validação de QTLs relacionados à robustez de leveduras industriais, BP.TT
Assunto(s):Repetições palindrômicas curtas agrupadas e regularmente espaçadas  Citometria de fluxo  Combustíveis  Energia renovável  Leveduras  Saccharomyces cerevisiae 

Resumo

O reconhecimento das consequências ambientais resultantes da utilização de combustíveis fósseis demanda um aumento significativo do uso de fontes de energia renovável. Neste contexto, destaca-se o etanol lignocelulósico, devido à possibilidade de maior aproveitamento da matéria-prima. No entanto, a viabilidade econômica de processos industriais é multifatorial e depende do desempenho das leveduras utilizadas. Por essa razão, leveduras adaptadas às condições industriais - leveduras industriais - têm sido consideradas plataformas adequadas para o desenvolvimento de linhagens, além de alvos para o estudo de genes que conferem tolerância aos estresses observados em condições industriais. Compreender as bases genéticas que conferem robustez à essas leveduras, contribuirá para sua melhoria e para o desenvolvimento de novas linhagens. Porém, tais características são em grande parte determinadas por múltiplos genes - Quantitative Trait Loci (QTLs) -, cuja identificação exige a análise fenotípica de um alto número de segregantes e validação dos possíveis alelos relacionados ao fenótipo estudado. Neste contexto, este trabalho tem como principal objetivo desenvolver ferramentas que tornem o estudo de QTLs mais preciso, menos laborioso e com melhor relação custo-benefício, acelerando o desenvolvimento de linhagens aplicadas à processos industriais. Para isso, pretende-se otimizar métodos de análise e dissecção de tétrades por citometria de fluxo, desenvolver métodos high-throughput automatizados para a fenotipagem de segregantes, implementar ferramentas de bioinformática para o mapeamento de QTLs e otimizar abordagens multiplex baseadas no sistema CRISPR/Cas9 para validação dos potenciais alelos relacionados aos fenótipos estudados. (AU)

Publicações científicas
(Referências obtidas automaticamente do Web of Science e do SciELO, por meio da informação sobre o financiamento pela FAPESP e o número do processo correspondente, incluída na publicação pelos autores)
NAGAMATSU, SHEILA TIEMI; TEIXEIRA, GLEIDSON SILVA; BEZERRA DE MELLO, FELLIPE DA SILVEIRA; GALVAO TIZEI, PEDRO AUGUSTO; GRICHOSWSKI NAKAGAWA, BRUNA TATSUE; DE CARVALHO, LUCAS MIGUEL; GUIMARAES PEREIRA, GONCALO AMARANTE; CARAZZOLLE, MARCELO FALSARELLA. Genome Assembly of a Highly Aldehyde-Resistant Saccharomyces cerevisiae SA1-Derived Industrial Strain. MICROBIOLOGY RESOURCE ANNOUNCEMENTS, v. 8, n. 13 MAR 2019. Citações Web of Science: 0.
BEZERRA DE MELLO, FELLIPE DA SILVEIRA; VENEGA CORADINI, ALESSANDRO LUIS; GALVAO TIZEI, PEDRO AUGUSTO; CARAZZOLLE, MARCELO FALSARELLA; GUIMARAES PEREIRA, GONCALO AMARANTE; TEIXEIRA, GLEIDSON SILVA. Static microplate fermentation and automated growth analysis approaches identified a highly-aldehyde resistant Saccharomyces cerevisiae strain. BIOMASS & BIOENERGY, v. 120, p. 49-58, JAN 2019. Citações Web of Science: 2.

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