Desenvolvimento de um Algoritmo Evolutivo para o Problema de Predição de Estrutura Terciária de Proteínas

• Processo: 07/06928-4
• Modalidade de apoio: Bolsas no Brasil - Mestrado
• Data de Início da vigência: 01 de março de 2008
• Data de Término da vigência: 28 de fevereiro de 2010
• Área de conhecimento: Ciências Exatas e da Terra - Ciência da Computação
• Pesquisador responsável: Alexandre Cláudio Botazzo Delbem
• Beneficiário: Paulo Henrique Ribeiro Gabriel
• Instituição Sede: Instituto de Ciências Matemáticas e de Computação (ICMC). Universidade de São Paulo (USP). São Carlos , SP, Brasil
• Assunto(s): Computação bioinspirada Energia livre Biologia computacional Computação evolutiva
• Palavra(s)-Chave do Pesquisador: Biologia Computacional | computação evolutiva | Dobramento de Proteinas | Energia Livre | Estruturas de proteínas | Computação Bioinspirada

Resumo

A predição de estruturas de proteínas é uma das áreas mais estudadas da biologia computacional. Não há, porém, uma técnica computacional eficiente que permita obter a estrutura tridimensional da molécula com base apenas na seqüência de aminoácidos que a compõe. Assim, tem-se estudado heurísticas e meta-heurísticas de busca e otimização com o objetivo de obter soluçõesconfiáveis em tempo de computação aceitável. Entre essas técnicas, estão os algoritmos evolutivos. O desenvolvimento de um algoritmo evolutivo para predição de estruturas de proteínas com base em seqüências de aminoácidos relativamente grandes é o principal objetivo deste projeto.

Publicações acadêmicas

(Referências obtidas automaticamente das Instituições de Ensino e Pesquisa do Estado de São Paulo)

GABRIEL, Paulo Henrique Ribeiro. Algoritmos evolutivos e modelos simplificados de proteínas para predição de estruturas terciárias. 2010. Dissertação de Mestrado - Universidade de São Paulo (USP). Instituto de Ciências Matemáticas e de Computação (ICMC/SB) São Carlos.