Proposição dos modelos de expansão intragenômica dos elementos transponíveis 412, F e Bari em Drosophila melanogaster e D. simulans e análise de fatores que possam interferir na dinâmica de transposição

• Processo: 08/07629-3
• Modalidade de apoio: Bolsas no Brasil - Mestrado
• Data de Início da vigência: 01 de março de 2009
• Data de Término da vigência: 28 de fevereiro de 2011
• Área de conhecimento: Ciências Biológicas - Genética - Genética Animal
• Pesquisador responsável: Claudia Marcia Aparecida Carareto
• Beneficiário: Elaine Silva Dias
• Instituição Sede: Instituto de Biociências, Letras e Ciências Exatas (IBILCE). Universidade Estadual Paulista (UNESP). Campus de São José do Rio Preto. São José do Rio Preto , SP, Brasil
• Assunto(s): Drosophila Evolução molecular
• Palavra(s)-Chave do Pesquisador: Drosophila | Elementos transponíveis | Expansão genômica | retroposon F | retrotransposon 412 | transposon Bari | Evolução Molecular

Resumo

O método de Median Joining Network têm sido utilizado para análise das relações entre as cópias de famílias e de subfamílias de elementos transponíveis por mostrar-se adequado para analisar relações evolutivas de seqüências intraespecíficas que apresentam baixa divergência. O presente estudo tem como objetivo analisar o modelo de expansão dos elementos transponíveis 412, F e Bari (1 e 2) em D. melanogaster e D. simulans, de modo a caracterizá-los dentro dos modelos "master copy", "transposon" ou "intermediário" por meio de uma análise de Median Joining Network. Para isso, será realizada uma análise in sílico para identificar os elementos transponíveis 412, F e Bari nos genomas seqüenciados de D. melanogaster e D. simulans. Essas seqüências serão alinhadas e agrupadas com o auxílio da ferramenta Network, resultando na obtenção do modelo de expansão das seqüências de TEs de cada família, em cada espécie. Também serão realizadas análises moleculares (amplificação, clonagem e sequenciamento) em linhagens oriundas de populações naturais, ancestrais, anciãs e invasoras, das duas espécies para obter as seqüências desses elementos, que serão alinhadas e agrupadas para análise do modelo de expansão. Além de permitir propor o modelo de expansão intragenômica desses elementos, este estudo propiciará elementos para avaliar se fatores intrínsecos aos elementos (sub-classe a que pertencem, proporção total de elementos no genoma, número de inserções específico do elemento estudado), das espécies (tamanho do genoma, tamanho populacional, estado ancestral, ancião ou colonizador) e do ambiente (temperatura) interferem nessa dinâmica.

Publicações científicas

(As publicações científicas contidas nesta página são originárias da Web of Science ou da SciELO, cujos autores mencionaram números dos processos FAPESP concedidos a Pesquisadores Responsáveis e Beneficiários, sejam ou não autores das publicações. Sua coleta é automática e realizada diretamente naquelas bases bibliométricas)

DIAS, ELAINE SILVA; APARECIDA CARARETO, CLAUDIA MARCIA. . GENETICS RESEARCH, v. 93, n. 6, p. 381-385, DEC 2011. (08/07629-3, 10/10731-4)

DIAS, ELAINE SILVA; APARECIDA CARARETO, CLAUDIA MARCIA. . BMC Evolutionary Biology, v. 12, JUL 23 2012. (08/07629-3, 10/10731-4)

Publicações acadêmicas

(Referências obtidas automaticamente das Instituições de Ensino e Pesquisa do Estado de São Paulo)

DIAS, Elaine Silva. Proposição dos modelos de expansão genômica dos elementos de transposição 412 e Bari no genoma de espécies do grupo melanogaster e em populações naturais de Drosophila melanogaster e de D. simulans. 2011. Dissertação de Mestrado - Universidade Estadual Paulista (Unesp). Instituto de Biociências Letras e Ciências Exatas. São José do Rio Preto São José do Rio Preto.