Modelagem de vias de sinalização em pesquisa sobre câncer

• Processo: 08/10011-1
• Modalidade de apoio: Bolsas no Brasil - Doutorado Direto
• Data de Início da vigência: 01 de maio de 2009
• Data de Término da vigência: 30 de abril de 2010
• Área de conhecimento: Interdisciplinar
• Pesquisador responsável: Eduardo Jordao Neves
• Beneficiário: Michel Mozinho dos Santos
• Instituição Sede: Instituto de Matemática e Estatística (IME). Universidade de São Paulo (USP). São Paulo , SP, Brasil
• Vinculado ao auxílio: 06/03227-2 - Expressão gênica em tumores do estômago e do esôfago: da biologia ao diagnóstico, AP.TEM
• Assunto(s): Biologia computacional Modelos matemáticos Transdução de sinais Neoplasias
• Palavra(s)-Chave do Pesquisador: câncer | microarray | modelagem matematica | Sistemas de Partículas Interagentes | vias de sinalização | Bioinformática

Resumo

Raramente uma função biológica pode ser atribuída a uma única molécula. Ao contrário entidades biomoleculares interagem no tempo e no espaço, em escalas que vão, respectivamente, de microsegundos a horas e de compartimentos celulares a organismos como um todo. Entender a dinâmica das redes de interação que guiam os fenômenos biológicos vem sendo considerado um desafio para a biologia deste século. A análise de modelos matemáticos de redes biomoleculares, por meio de ferramentas de sistemas dinâmicos, tem contribuído para o entendimento dos princípios básicos que orientam evolutivamente a organização dos circuitos biológicos. No entanto, a abordagem de modelagem atualmente predominante é sujeita muitas vezes a escolhas bastante arbitrárias e com pouco suporte experimental in vivo. Neste sentido, propõe-se o uso da modelagem pelo método, recentemente desenvolvido por nosso grupo, de perfil de densidade e o confronto dos modelos contra dados experimentais. Por exemplo, microarranjos de séries temporais podem capturar o comportamento dinâmico de milhares de genes ao mesmo tempo e os dados gerados podem ser comparados com predições de modelos dos processos biológicos. Microarranjos têm sido empregados na pesquisa do câncer, em particular pelo grupo de pesquisa no qual o presente projeto se insere. No câncer, ocorre a disfunção de diversas vias de sinalização que podem levar a problemas de múltiplas escalas: intracelular, microambiental e tecidual. Neste projeto, pretendemos colaborar para o entendimento de alguns desses processos biológicos relacionados ao câncer. (AU)