Caracterização termodinâmica do enovelamento de proteínas usando modelos baseados em estrutura

• Processo: 10/04905-0
• Modalidade de apoio: Bolsas no Brasil - Mestrado
• Data de Início da vigência: 01 de agosto de 2010
• Data de Término da vigência: 29 de fevereiro de 2012
• Área de conhecimento: Ciências Biológicas - Biofísica - Biofísica Molecular
• Pesquisador responsável: Vitor Barbanti Pereira Leite
• Beneficiário: Débora Tavares de Lima
• Instituição Sede: Instituto de Biociências, Letras e Ciências Exatas (IBILCE). Universidade Estadual Paulista (UNESP). Campus de São José do Rio Preto. São José do Rio Preto , SP, Brasil
• Assunto(s): Simulação de dinâmica molecular Frustração
• Palavra(s)-Chave do Pesquisador: Dinâmica Molecular | Enovelamento de proteínas | Frustração | modelo baseado em estrutura | Enovelamento de proteínas

Resumo

O enovelamento de proteína é um problema de grande relevância em física biológica. Modelos teórico-computacionais são usados no estudo do mecanismo de enovelamento. Por meio de simulações computacionais, é possível acompanhar cada detalhe do processo de enovelamento de proteínas. Neste estudo utilizaremos a abordagem conhecida como teoria de Superfície de Energia (Energy Landscape) que trata o enovelamento por uma descrição estatística. O modelo utilizado será um modelo basedo em estrutura conhecido como modelo C-alpha , e acrescentaremos a esse modelo um parâmetro de frustração. Na literatura há uma conjectura que diz que um pouco de frustração auxilia no processo do enovelamento. No entanto, o nosso grupo tem resultados preliminares que indicam que, para algumas proteínas, com pequenas barreiras de energia, a frustração não favorece o enovelamento. Estudaremos as propriedades termodinâmicas de um grupo de proteínas e determinaremos um limiar em que a frustração auxilia o enovelamento. (AU)

Publicações acadêmicas

(Referências obtidas automaticamente das Instituições de Ensino e Pesquisa do Estado de São Paulo)

LIMA, Débora Tavares de. Regimes de frustração ótima em enovelamento de proteínas com modelos baseado em estrutura. 2012. Dissertação de Mestrado - Universidade Estadual Paulista (Unesp). Instituto de Biociências Letras e Ciências Exatas. São José do Rio Preto São José do Rio Preto.