Caracterizacao bioquimica e estrutural das interacoes da proteina rrp43 com outras subunidades do exossomos de levedura.

• Processo: 11/50604-4
• Modalidade de apoio: Bolsas no Brasil - Pós-Doutorado
• Data de Início da vigência: 01 de setembro de 2011
• Data de Término da vigência: 30 de novembro de 2013
• Área de conhecimento: Ciências Biológicas - Bioquímica - Bioquímica de Microorganismos
• Pesquisador responsável: Carla Columbano de Oliveira
• Beneficiário: Rogério Ferreira Lourenço
• Instituição Sede: Instituto de Química (IQ). Universidade de São Paulo (USP). São Paulo , SP, Brasil
• Vinculado ao auxílio: 10/51842-3 - SMOLBNET2: estudo de estrutura de proteínas componentes e reguladoras do exossomo de Archaea e de levedura, AP.TEM
• Assunto(s): Leveduras Exossomos
• Palavra(s)-Chave do Pesquisador: Degradacao De Rna | Exossomo | Levedura | Rrp43

Resumo

Em arqueas e eucariotos, a degradação das moléculas de RNA na direção 3'→5' é dependente de um aparato molecular estruturalmente conservado, o exossomo. Segundo os modelos disponíveis, esse aparato é constituído por um anel hexamérico similar à RNase PH de bactérias, associado a um trímero com capacidade de se ligar a RNA. Enquanto o anel hexamérico catalisa a degradação de RNA em arqueas, nenhuma atividade nucleolítica foi observada para o correspondente eucariótico. Em eucariotos, o exossomo tem um número maior de subunidades e a sua atividade exonucleolítica 3'→5' é desempenhada por nucleases hidrolíticas que se associam fisicamente ao complexo formado pelo anel hexamérico e pelo trímero de ligação a RNA. Todavia, a montagem do núcleo cataliticamente inerte do exossomo parece ser de fundamental importância para a atividade desse complexo, já que mutações em regiões que provavelmente não interagem com RNA ou com as nucleases podem levar à inativação in vivo do exossomo. No laboratório da Profª. Carla Columbano de Oliveira, mutações como essas foram isoladas no gene que codifica a subunidade Rrp43 do anel hexamérico do exossomo de levedura. Com o objetivo de entender as causas da inativação do exossomo em linhagens mutantes nessa subunidade, o presente projeto visa à caracterização bioquímica e estrutural das interações de Rrp43 com outras subunidades do exossomo de levedura. Uma vez que o exossomo de levedura ainda não foi caracterizado estruturalmente, a obtenção das estruturas dos subcomplexos do exossomo será de fundamental importância para confirmar o modelo estrutural predito a partir de dados genéticos e bioquímicos e contribuirá para o entendimento do papel de subunidades do complexo na sua montagem, estabilização e atividade. (AU)

Publicações científicas

(Referências obtidas automaticamente do Web of Science e do SciELO, por meio da informação sobre o financiamento pela FAPESP e o número do processo correspondente, incluída na publicação pelos autores)

DA SILVA, CAROLINA A. P. T.; LOURENCO, ROGERIO F.; MAZZON, RICARDO R.; RIBEIRO, RODOLFO A.; MARQUES, MARILIS V.. Transcriptomic analysis of the stationary phase response regulator SpdR in Caulobacter crescentus. BMC Microbiology, v. 16, APR 12 2016. (14/04046-8, 11/18847-4, 12/10563-0, 11/17513-5, 11/50604-4)

SANTOS, JULIANA S.; DA SILVA, CAROLINA A. P. T.; BALHESTEROS, HELOISE; LOURENCO, ROGERIO F.; MARQUES, MARILIS V.. CspC regulates the expression of the glyoxylate cycle genes at stationary phase in Caulobacter. BMC Genomics, v. 16, AUG 27 2015. (14/04046-8, 11/21883-2, 09/52883-8, 12/10563-0, 11/17513-5, 11/50604-4)

LOURENCO, ROGERIO F.; LEME, ADRIANA F. P.; OLIVEIRA, CARLA C.. Proteomic Analysis of Yeast Mutant RNA Exosome Complexes. JOURNAL OF PROTEOME RESEARCH, v. 12, n. 12, p. 5912-5922, DEC 2013. (10/51842-3, 11/50604-4)