Métodos de análise de bioinformática de dados complexos de genética molecular

• Processo: 11/20069-0
• Modalidade de apoio: Bolsas no Brasil - Programa Capacitação - Treinamento Técnico
• Data de Início da vigência: 01 de dezembro de 2011
• Data de Término da vigência: 31 de março de 2013
• Área de conhecimento: Ciências da Saúde - Medicina
• Pesquisador responsável: Fernando Cendes
• Beneficiário: Rodrigo Secolin
• Instituição Sede: Faculdade de Ciências Médicas (FCM). Universidade Estadual de Campinas (UNICAMP). Campinas , SP, Brasil
• Vinculado ao auxílio: 05/56578-4 - Centro multimodal de neuroimagens para estudos em epilepsia, AP.CINAPCE.TEM
• Assunto(s): Epilepsia Biologia computacional Neurologia Mutação
• Palavra(s)-Chave do Pesquisador: Análises de microarrays | bioinformática | Doenças Complexas | epilepsia | Mutações | Neurologia

Resumo

O presente projeto de TT visa: (1) Identificação, avaliação e validação de softwares/base de dados públicos ou comerciais. (2) Desenvolvimento de métodos para manipulação e interpretação de dados de NSG (Nextgeneration sequencing) no contexto de pesquisa de genética médica. O objetivo específico será o de fornecer um método capaz de extrair e classificar as variantes de um conjunto de reads curtos obtidos a partir de um genoma humano. (3) Análise de genes/miRNAs diferencialmente expressos em microarrays, para diferentes formas de epilepsia. (4) Criação e desenvolvimento de banco de dados. (5) Desenvolvimento de estratégia in silico para análise de dados: filtragem de variantes de acordo com as regras de mineração de dados. (6) Extração de dados, utilizando os recursos disponíveis para investigar os mecanismos moleculares de patogenicidade, incluindo bases de dados de mutações de genes (OMIM) e patologia (dados clínicos e genéticos).