Homólogos a At-thi1 em cana-de-açúcar: estudo molecular e funcional

• Processo: 12/02671-7
• Modalidade de apoio: Bolsas no Brasil - Doutorado Direto
• Data de Início da vigência: 01 de março de 2012
• Data de Término da vigência: 31 de janeiro de 2015
• Área de conhecimento: Ciências Biológicas - Genética - Genética Vegetal
• Pesquisador responsável: Marie-Anne Van Sluys
• Beneficiário: Andréia Prata Vieira
• Instituição Sede: Instituto de Biociências (IB). Universidade de São Paulo (USP). São Paulo , SP, Brasil
• Vinculado ao auxílio: 08/52074-0 - Sugarcane genome sequence: plant transposable elements are active contributors to gene structure variation, regulation and function, AP.BIOEN.TEM
• Assunto(s): Genética molecular vegetal Genômica Expressão gênica Cana-de-açúcar Leveduras Metabolismo energético
• Palavra(s)-Chave do Pesquisador: caracterização genômica | complementação funcional | gene thi1 | homólogos de cana-de-açúcar | Metabolismo energético | saccharomyces | Genética molecular

Resumo

A cana-de-açúcar (Saccharum spp.) é uma monocotiledônea de metabolismo C4, que apresenta grande acúmulo de sacarose no colmo. Trata-se de uma importante cultura tropical cultivada para a obtenção de açúcar e, mais recentemente, do biocombustível etanol, entre outros produtos. Apesar de sua importância econômica, pouco ainda se conhece sobre a estrutura do seu genoma. Sabe-se que os cultivares modernos são híbridos interespecíficos que apresentam um genoma altamente complexo. O programa SUCEST (Sugarcane EST Project - Vettore et al., 2003) produziu sequências do transcriptoma dessa planta, de forma a iniciar o estudo das regiões codificantes. A partir do banco de reads do SUCEST, dois SAS (Sugarcane Assembled Sequences), denominados SAS1_SC-THI1 e SAS2_sc-thi1, foram identificados como possíveis homólogos do gene thi1 de Arabdopsis thaliana e thi4 de Saccharomyces cerevisiae. Esses genes estão envolvidos na biossíntese do anel tiazol, um dos componentes da tiamina (vitamina B1) necessária ao funcionamento energético das células, sendo cofator para enzimas que atuam em diversas vias metabólicas. Enquanto A. thaliana e outras espécies vegetais apresentam apenas uma cópia deste gene, cana apresenta pelo menos duas cópias, assim como outras gramíneas C4. Resultados anteriores do nosso grupo observaram que o mutante tz-201 de A. thaliana, apresenta acúmulo de sacarose nos tecidos. Esses resultados, juntamente com a existência de dois transcritos com perfil de expressão distintos no SUCEST, tornam interessante a averiguação da função dos homólogos de cana-de-açúcar. Assim, o presente projeto tem como objetivo estudar a função desses dois possíveis genes através de análises de expressão, estudo de complementação em mutante de levedura THI4, além da caracterização do contexto genômico dos genes em cana-de-açúcar. (AU)

Publicações científicas

(Referências obtidas automaticamente do Web of Science e do SciELO, por meio da informação sobre o financiamento pela FAPESP e o número do processo correspondente, incluída na publicação pelos autores)

OCHOA CRUZ, EDGAR ANDRES; QUEIROGA CRUZ, GUILHERME MARCELLO; VIEIRA, ANDREIA PRATA; VAN SLUYS, MARIE-ANNE. Virus-like attachment sites as structural landmarks of plants retrotransposons. MOBILE DNA, v. 7, JUL 28 2016. (12/21064-4, 08/58243-8, 12/02671-7, 08/52074-0)

CRUZ, GUILHERME M. Q.; METCALFE, CUSHLA J.; DE SETTA, NATHALIA; CRUZ, EDGAR A. O.; VIEIRA, ANDREIA PRATA; MEDINA, ROSARIO; VAN SLUYS, MARIE-ANNE. Virus-Like Attachment Sites and Plastic CpG Islands: Landmarks of Diversity in Plant Del Retrotransposons. PLoS One, v. 9, n. 5, MAY 21 2014. (09/51632-1, 08/52074-0, 09/09217-7, 12/14610-2, 08/58243-8, 12/02671-7)

Publicações acadêmicas

(Referências obtidas automaticamente das Instituições de Ensino e Pesquisa do Estado de São Paulo)

VIEIRA, Andréia Prata. Homólogos a thi1 em cana-de-açúcar: estudo molecular e funcional. 2018. Tese de Doutorado - Universidade de São Paulo (USP). Escola Superior de Agricultura Luiz de Queiroz (ESALA/BC) Piracicaba.