Desenvolvimento de modelo genético-estatístico para a análise da interação genótipo e ambiente em estudos de genética associativa

• Processo: 12/13272-6
• Modalidade de apoio: Bolsas no Brasil - Pós-Doutorado
• Vigência (Início): 01 de outubro de 2012
• Vigência (Término): 28 de fevereiro de 2014
• Área do conhecimento: Ciências Agrárias - Agronomia - Fitotecnia
• Pesquisador responsável: Antonio Augusto Franco Garcia
• Beneficiário: Rodrigo Gazaffi
• Instituição Sede: Escola Superior de Agricultura Luiz de Queiroz (ESALQ). Universidade de São Paulo (USP). Piracicaba , SP, Brasil
• Assunto(s): Melhoramento genético vegetal Interação gene-ambiente Genética estatística Genética quantitativa Tolerância a seca Sorgo Polimorfismo de um único nucleotídeo Controle genético Segurança alimentar
• Palavra(s)-Chave do Pesquisador: Estresse Hídrico | Genética Estatística | Genética quantitativa | mapeamento associativo | modelos mistos | Sorgo | Melhoramento Genético Vegetal

Resumo

O estresse hídrico é um dos principais fatores responsáveis pela redução da produção agrícola no mundo, com reflexos significativos na segurança alimentar. A tolerância à seca apresenta controle genético ainda pouco conhecido, porém sendo possível observar resposta diferencial em diferentes acessos de sorgo. A utilização do mapeamento associativo, principalmente aliado ao mapeamento de QTLs em populações estruturadas tem grande potencial na elucidação do controle genético deste caráter pelo estabelecimento de associações estatísticas entre marcadores moleculares de polimorfismo de base única (SNP - Single Nucleotide Polymorphism) e o fenótipo. No entanto, modelos genético-estatísticos visando à incorporação da interação entre genótipo e ambiente nos modelos associativos não foram desenvolvidos, o que restringe o uso prático das informações geradas no melhoramento genético. Dentre as principais vantagens dessa estratégia é a possibilidade de estudo da interação entre SNP e ambientes, permitindo a compreensão detalhada do controle genético, gerando informações valiosas à aplicação destes resultados em programas de seleção assistida por marcadores. Neste contexto, o presente trabalho tem por objetivo estudar o controle genético da tolerância à seca em um painel associativo de sorgo, incluindo, para tanto, o desenvolvimento de modelos adequados para o mapeamento de SNP considerando a interação entre genótipos e ambientes. O painel de sorgo consiste de 377 acessos que inicialmente foram genotipados com 1536 SNP e atualmente estão sendo genotipados por resequenciamento e avaliados para a tolerância à seca em condições de campos em dois ambientes. (AU)

Publicações científicas

(Referências obtidas automaticamente do Web of Science e do SciELO, por meio da informação sobre o financiamento pela FAPESP e o número do processo correspondente, incluída na publicação pelos autores)

GAZAFFI, RODRIGO; MARGARIDO, GABRIEL R. A.; PASTINA, MARIA MARTA; MOLLINARI, MARCELO; GARCIA, ANTONIO AUGUSTO F.. A model for quantitative trait loci mapping, linkage phase, and segregation pattern estimation for a full-sib progeny. Tree Genetics & Genomes, v. 10, n. 4, p. 791-801, AUG 2014. (07/02775-9, 12/13272-6, 10/00083-5, 08/54402-4)

ROSARIO, M. F.; GAZAFFI, R.; MOURA, A. S. A. M. T.; LEDUR, M. C.; COUTINHO, L. L.; GARCIA, A. A. F.. Composite interval mapping and mixed models reveal QTL associated with performance and carcass traits on chicken chromosomes 1, 3, and 4. JOURNAL OF APPLIED GENETICS, v. 55, n. 1, p. 97-103, FEB 2014. (04/02080-2, 10/50019-1, 12/13272-6)