Desenvolvimento de um modelo para construção de mapas genéticos em autopoliploides, com aplicações em cana-de-açúcar

• Processo: 08/54402-4
• Linha de fomento: Bolsas no Brasil - Doutorado
• Vigência (Início): 01 de novembro de 2008
• Vigência (Término): 29 de fevereiro de 2012
• Área do conhecimento: Ciências Agrárias - Agronomia - Fitotecnia
• Pesquisador responsável: Antonio Augusto Franco Garcia
• Beneficiário: Marcelo Mollinari
• Instituição-sede: Escola Superior de Agricultura Luiz de Queiroz (ESALQ). Universidade de São Paulo (USP). Piracicaba , SP, Brasil
• Assunto(s): Cana-de-açúcar Saccharum Marcador molecular Melhoramento genético vegetal

Resumo

A cana-de-açúcar (Saccharum spp.) representa para o Brasil uma importante fonte de renda, emprego e energia, com participação significativa na economia nacional. Com o surgimento dos marcadores moleculares, tornou-se possível compreender melhor a herança dos caracteres poligênicos, devido à sua aplicação nos estudos sobre QTL's, ou locos que controlam caracteres quantitativos. Atualmente, existem inúmeras metodologias disponíveis para o mapeamento de QTL's, incluindo mapeamento por intervalo simples e composto, métodos bayesianos e mapeamento por múltiplos intervalos. No entanto, essas metodologias foram desenvolvidas para aplicação em populações experimentais provenientes do cruzamento entre linhagens endogamias, como retrocruzamentos, F2 e RIL's ("Recombinant Inbred Lines"). Para muitas espécies, como é o caso da cana-de-açúcar, é difícil ou impossível obter linhagens homozigóticas, sendo utilizadas populações F1, nas quais um único loco pode apresentar até 4 alelos, resultando em diferentes tipos de segregação e, além disso, as fases de ligação entre marcadores e entre marcadores e QTL's são desconhecidas. Nesse contexto, o presente trabalho tem por objetivo o desenvolvimento de modelos genético-estatísticos que permitam o mapeamento de QTL's em cana-de-açúcar, utilizando a abordagem de modelos mistos, considerando informações de múltiplos caracteres e ambientes simultaneamente. Esse modelo será empregado para a análise de dados reais de cana-de-açúcar: uma progênie F1, que já foi usada para construir um mapa de ligação nessa espécie (Garcia et al. 2006, Oliveira et al. 2007). Os caracteres a serem avaliados são: percentual de POL na cana (POL% cana ou PCC), percentual de matéria seca insolúvel em água contida na cana (fibra%) e produtividade de cana-de-açúcar em toneladas de cana por hectare (TCH). Pretende-se com isso estudar a base genética da correlação entre esses caracteres de grande importância agronômica, bem como a interação entre QTL's e ambientes e, com isso, fornecer subsídios aos programas de melhoramento de cana-de-açúcar. (AU)

Publicações científicas

(Referências obtidas automaticamente do Web of Science e do SciELO, por meio da informação sobre o financiamento pela FAPESP e o número do processo correspondente, incluída na publicação pelos autores)

GAZAFFI, RODRIGO; MARGARIDO, GABRIEL R. A.; PASTINA, MARIA MARTA; MOLLINARI, MARCELO; GARCIA, ANTONIO AUGUSTO F. A model for quantitative trait loci mapping, linkage phase, and segregation pattern estimation for a full-sib progeny. Tree Genetics & Genomes, v. 10, n. 4, p. 791-801, AUG 2014. Citações Web of Science: 12.

SERANG, OLIVER; MOLLINARI, MARCELO; FRANCO GARCIA, ANTONIO AUGUSTO. Efficient Exact Maximum a Posteriori Computation for Bayesian SNP Genotyping in Polyploids. PLoS One, v. 7, n. 2 FEB 17 2012. Citações Web of Science: 45.

MOLLINARI, M.; MARGARIDO, G. R. A.; VENCOVSKY, R.; GARCIA, A. A. F. Evaluation of algorithms used to order markers on genetic maps. HEREDITY, v. 103, n. 6, p. 494-502, DEC 2009. Citações Web of Science: 23.

Publicações acadêmicas

(Referências obtidas automaticamente das Instituições de Ensino e Pesquisa do Estado de São Paulo)

MOLLINARI, Marcelo. Desenvolvimento de um modelo para construção de mapas genéticos em autopoliploides, com aplicações em cana-de-açúcar. 2012. Tese de Doutorado - Universidade de São Paulo (USP). Escola Superior de Agricultura Luiz de Queiroz Piracicaba.