| Processo: | 12/13321-7 |
| Modalidade de apoio: | Bolsas no Brasil - Pós-Doutorado |
| Data de Início da vigência: | 01 de fevereiro de 2013 |
| Data de Término da vigência: | 30 de junho de 2016 |
| Área de conhecimento: | Ciências Agrárias - Agronomia - Ciência do Solo |
| Pesquisador responsável: | Tsai Siu Mui |
| Beneficiário: | Acacio Aparecido Navarrete |
| Instituição Sede: | Centro de Energia Nuclear na Agricultura (CENA). Universidade de São Paulo (USP). Piracicaba , SP, Brasil |
| Bolsa(s) vinculada(s): | 15/09436-1 - Aplicação de geochip para prospecção de genes funcionais microbianos com potencial para atuar como bioindicadores de distúrbios em solos cultivados com cana-de-açúcar sob aplicação de zinco, BE.EP.PD 14/06077-8 - Anotação metagenômica e análise de bioinformática aplicada à definição de bioindicadores microbianos para os efeitos do manejo agrícola do solo em sistemas de produção de cana-de-açúcar, BE.EP.PD |
| Assunto(s): | Sequenciamento de nova geração Biologia computacional Microbiologia do solo |
| Palavra(s)-Chave do Pesquisador: | bioinformática | Genes funcionais | Indicadores De Qualidade Do Solo | manejo agrícola do solo | Microbiologia do solo | sequenciamento de nova geração | Microbiologia e Bioquímica do Solo |
Resumo A definição e monitoramento de parâmetros de qualidade do solo são fundamentais para a produção primária sustentável de matéria-prima utilizada em processos industriais de base biológica. Nesse sentido, novas metodologias baseadas em sequenciamento de DNA podem associar-se à metodologias tradicionais e contribuir diretamente para a definição de parâmetros biologicamente relevantes que permitam avaliar com maior sensibilidade os potenciais impactos de tais processos de produção sobre o estado de qualidade de um solo. Resultados recentes obtidos no âmbito do programa Capes/Wageningen (Navarrete et al., 2012) revelaram membros dos filos Acidobacteria e Verrucomicrobia (ao nível taxonômico de classe) e genes relacionados ao ciclo biogeoquímico do carbono como potenciais bio-indicadores para o efeito do desmatamento no solo e manejo agrícola para produção de soja no estado de Mato Grosso, Brasil. Nesse sentido, a presente proposta visa validar esses resultados num outro contexto agrícola brasileiro combinando métodos moleculares de ponta com metodologias tradicionais, a fim de atestar esses bio-indicadores microbianos para avaliação de perturbações no ambiente do solo em sistemas de produção de cana-de-açúcar no estado de São Paulo. Para tanto, o objetivo deste projeto de pesquisa é validar taxa bacterianos (Acidobacteria e Verrucomicrobia) e identificar grupos e genes microbianos com potencial uso como bio-indicadores taxonômicos e funcionais e associá-los à características e processos do solo, tais como fertilidade, disponibilidade de nutrientes, biomassa microbiana, atividade enzimática e emissão de óxido nitroso (N2O), dióxido de carbono (CO2) e metano (CH4) a partir do solo em sistemas de produção de cana-de-açúcar no estado de São Paulo. O plano de atividades está organizado em três diferentes módulos: (i) "bio-indicadores taxonômicos", contemplando a determinação da abundância de Acidobacteria e Verrucomicrobia e também de outros grupos bacterianos por sequenciamento parcial do gene 16S rRNA usando plataforma de nova geração (pirosequenciamento) e correlação estatística com atributos físicos e químicos do solo; (ii) "bio-indicadores funcionais", envolvendo análise quantitativa e comparativa de dados metagenômicos (shotgun MiSeq) juntamente com atributos físicos, químicos, biológicos e bioquímicos do solo e com os fluxos de N2O, CO2 e CH4 quantificados a partir do solo; e (iii) "bioinformática e estatística", englobando o uso de programas computacionais e estatísticos para a integração dos resultados obtidos nos módulos "i" e "ii", visando, assim, assegurar a indicação dos bio-indicadores taxonômicos e funcionais para avaliar a qualidade do solo em sistemas de produção de cana-de-açúcar. | |
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