Using. Metagenomics to Connect Microbial Community Biodiversity and Functions

Autor(es)

Mendes, Lucas W. ; Perez Braga, Lucas Palma ; Navarrete, Acacio A. ; de Souza, Dennis Goss ; Silva, Genivaldo G. Z. ; Tsai, Siu M.

• Tipo de documento: Artigo de Revisão
• Fonte: CURRENT ISSUES IN MOLECULAR BIOLOGY; v. 24, p. 103-118, 2017.
• Citações Web of Science: 0

Resumo

Microbes constitute about a third of the Earth's biomass and are composed by an enormous genetic diversity. In a majority of environments the microbial communities play crucial roles for the ecosystem functioning, where a drastic biodiversity alteration or loss could lead to negative effects on the environment and sustainability. A central goal in microbiome studies is to elucidate the relation between microbial diversity to functions. A better understanding of the relation diversity-function would increase the ability to manipulate that diversity to improve plant and animal health and also setting conservation priorities. The recent advances in genomic methodologies in microbial ecology have provided means to assess highly complex communities in detail, making possible the link between diversity and the functions performed by the microbes. In this work we first explore some advances in bioinformatics tools to connect the microbial community biodiversity to their potential metabolism and after present some examples of how this information can be useful for a better understanding of the microbial role in the environment. (AU)

• Processo FAPESP: 15/00251-9 - Análise do microbioma associado ao sistema radicular de feijão
• Beneficiário: Lucas William Mendes
• Linha de fomento: Bolsas no Exterior - Estágio de Pesquisa - Pós-Doutorado
• Processo FAPESP: 13/22845-2 - Interações entre comunidade microbiana do solo de canavial e minhocas na decomposição da palhada e na emissão de gases do efeito estufa (GEE)
• Beneficiário: Lucas Palma Perez Braga
• Linha de fomento: Bolsas no Brasil - Doutorado
• Processo FAPESP: 12/13321-7 - Bio-indicadores microbianos taxonômicos e funcionais em solos sob sistemas de produção de cana-de-açúcar
• Beneficiário: Acacio Aparecido Navarrete
• Linha de fomento: Bolsas no Brasil - Pós-Doutorado
• Processo FAPESP: 10/20353-7 - Análise das comunidades microbianas em solos sob diferentes usos da terra na fronteira de expansão agrícola no Sudoeste da Amazônia
• Beneficiário: Lucas William Mendes
• Linha de fomento: Bolsas no Brasil - Doutorado
• Processo FAPESP: 11/51749-6 - Bioindicadores funcionais para monitoramento da qualidade do solo para o manejo sustentável da produção de biomassa em cana-de-açúcar (BIOSQ)
• Beneficiário: Tsai Siu Mui
• Linha de fomento: Auxílio à Pesquisa - Programa BIOEN - Regular
• Processo FAPESP: 14/03217-3 - Microbioma da rizosfera de feijão resistente ao patógeno de solo Fusarium oxysporum
• Beneficiário: Lucas William Mendes
• Linha de fomento: Bolsas no Brasil - Pós-Doutorado
• Processo FAPESP: 14/06077-8 - Anotação metagenômica e análise de bioinformática aplicada à definição de bioindicadores microbianos para os efeitos do manejo agrícola do solo em sistemas de produção de cana-de-açúcar
• Beneficiário: Acacio Aparecido Navarrete
• Linha de fomento: Bolsas no Exterior - Estágio de Pesquisa - Pós-Doutorado