Análise dos transcritos do RNA não-codificante BncDNA associado à presença de cromossomos B em Astatotilapia latifasciata

• Processo: 13/01688-6
• Modalidade de apoio: Bolsas no Exterior - Estágio de Pesquisa - Iniciação Científica
• Data de Início da vigência: 01 de julho de 2013
• Data de Término da vigência: 31 de julho de 2013
• Área de conhecimento: Ciências Biológicas - Genética - Genética Animal
• Pesquisador responsável: César Martins
• Beneficiário: Érica Ramos
• Supervisor: Rachel J. Waugh O'Neill
• Instituição Sede: Instituto de Biociências (IBB). Universidade Estadual Paulista (UNESP). Campus de Botucatu. Botucatu , SP, Brasil
• Instituição Anfitriã: University of Connecticut (UCONN), Estados Unidos
• Vinculado à bolsa: 12/20959-8 - Análise estrutural e funcional dos transcritos do DNA não-codificante BncDNA associado à presença de cromossomos B em Astatotilapia latifasciata, BP.IC
• Assunto(s): Citogenética Evolução molecular Cromossomos B
• Palavra(s)-Chave do Pesquisador: Citogenética | Cromossomo B | DNA repetitivo | Evolução | RNA não-codificante | citogenética

Resumo

Cromossomos B estão presentes em 15% das espécies de Eucariotos e, apesar de serem considerados elementos dispensáveis e parasitas do genoma, alguns estudos têm proposto uma importância funcional relevante a esses cromossomos. Dentre as espécies que possuem cromossomos supernumerários, Astatotilapia latifasciata é um ciclídeo africano que possui de 1 a 2 cromossomos B em aproximadamente 30% dos indivíduos. Nesta espécie foi encontrada uma sequência de DNA repetitivo espalhado por todo o cromossomo B que possui regiões de identidade com sequências dos genomas e transcriptomas das espécies de ciclídeos Metriaclima zebra, Astatotilapia burtoni e Oreochromis niloticus. Esta sequência de DNA não apresentou similaridade a nenhum tipo de elemento repetitivo ou sequência codificante de proteína já conhecidos, sugerindo tratar-se de uma sequência que está sendo transcrita em RNA não-codificante, denominada de BncDNA. Para o melhor entendimento da evolução e função dessa sequência no genoma de A. latifasciata, o presente estudo pretende identificar os transcritos de BncDNA e analisar seu potencial de transcrição de pequenos RNAs funcionais em diferentes tecidos de indivíduos portadores e não portadores de cromossomos B. (AU)