Sequenciamento de alta cobertura (RNA-seq) para detectar genes diferencialmente expressos envolvidos na modulação do ciclo celular de Plasmodium falciparum

• Processo: 13/13361-1
• Modalidade de apoio: Bolsas no Brasil - Pós-Doutorado
• Data de Início da vigência: 01 de setembro de 2013
• Data de Término da vigência: 31 de julho de 2016
• Área de conhecimento: Ciências Biológicas - Bioquímica - Bioquímica de Microorganismos
• Pesquisador responsável: Célia Regina da Silva Garcia
• Beneficiário: Giulliana Tessarin e Almeida
• Instituição Sede: Instituto de Biociências (IB). Universidade de São Paulo (USP). São Paulo , SP, Brasil
• Vinculado ao auxílio: 11/51295-5 - Genômica funcional em Plasmodium, AP.TEM
• Bolsa(s) vinculada(s): 14/26067-7 - Identificação de proteínas reguladas por melatonina que estão envolvidas no ciclo celular de Plasmodium falciparum, BE.EP.PD
• Assunto(s): Plasmodium falciparum Proteínas quinases Ubiquitinação Biologia molecular
• Palavra(s)-Chave do Pesquisador: modulação do ciclo celular | Plasmodium falciparum | Proteina quinase | Sequenciamento de alta cobertura | ubiquitinação | Biologia Molecular

Resumo

Trabalhos da ultima década têm revelado que o sistema de ubiquitinaproteossomo (UPS) desempenha papéis diversos em eucariotos incluindo controle de ciclo celular, regulação de transcrição e transdução de sinal. Infelizmente, para o parasitas Plasmodium , o entendimento sobre os mecanismos moleculares e consequências biológicas de ubiquitinação de proteínas ainda são escasso. De maneira geral, sabe-se que ocorre uma mudança significativa na expressão dos genes relacionados ao UPS quando células infectadas com Plasmodium falciparum são tratadas com melatonina Interessantemente, a resposta à melatonina é completamente abolida em parasitas nocauteados para a quinase PfPK7; e esta resposta é restaurada quando os parasitas são complementados para PfPK7. Neste projeto pretendemos realizar o sequenciamento de alta cobertura (RNA-seq) polyA+ extraído de trofozoítos de Plasmodium falciparum tratado com melatonina ( cepa 3D7 ) e trofozoítos de Plasmodium falciparum da cepa nocaute para a quinase PK7 para identificar possíveis alvos e avaliar a participação da proteína quinase 7 (PK7). Faremos um estudo detalhado do possível envolvimento da pfpk7 na expressão dos genes relacionados ao UPS. Além disso pretendemos identificar novos genes envolvidos no processo de sincronização dos parasitas.