Sequenciamento do transcriptoma e caracterização de microssatélites na Pirapitinga Piaractus brachypomus para análises de variabilidade genética

• Processo: 14/05732-2
• Modalidade de apoio: Bolsas no Brasil - Mestrado
• Data de Início da vigência: 01 de junho de 2014
• Data de Término da vigência: 29 de fevereiro de 2016
• Área de conhecimento: Ciências Agrárias - Recursos Pesqueiros e Engenharia de Pesca - Aquicultura
• Acordo de Cooperação: Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES)
• Pesquisador responsável: Diogo Teruo Hashimoto
• Beneficiário: Paulo Henrique Jorge
• Instituição Sede: Centro de Aquicultura (CAUNESP). Universidade Estadual Paulista (UNESP). Campus de Jaboticabal. Jaboticabal , SP, Brasil
• Assunto(s): Genética aplicada Piscicultura Sequenciamento de nova geração Transcriptoma Piaractus brachypomus Variação genética Repetições de microssatélites Marcador molecular
• Palavra(s)-Chave do Pesquisador: Aquicultura | Genética aplicada | Manejo Genético | Pirapitinga | Piscicultura | Transcriptoma | Genética

Resumo

A pirapitinga, Piaractus brachypomus (Characiformes, Serrasalmidae), é um peixe de ocorrência na Bacia Amazônica e uma das principais espécies nativas utilizadas para a produção em Aquicultura. Entretanto, é praticamente inexistentes estudos genéticos direcionados para esta espécie, em especial sobre variabilidade genética de estoques cultivados ou naturais. Neste caso, o fator limitante para avançar nestes estudos é a falta de marcadores moleculares disponíveis para P. brachypomus, considerado um organismo não modelo da Aquicultura. Atualmente, as tecnologias de Sequenciamento de Nova Geração (NGS) estão causando uma revolução na Biologia Molecular, pois têm possibilitado à descoberta de milhões de marcadores SNPs e microssatélites em organismos não modelos. O presente projeto tem como objetivo realizar o sequenciamento do transcriptoma de P. brachypomus por meio de NGS e, em seguida, caracterizar um conjunto de marcadores microssatélites para esta espécie. Por fim, com o estabelecimento dos microssatélites, pretende-se analisar estoques cultivados de reprodutores de pirapitinga em Pisciculturas brasileiras, como forma de conhecer o perfil genético destes animais e melhorar o manejo genético nos sistemas de produção. A caracterização de marcadores moleculares em P. brachypomus e estudos genéticos enfocando um maior conhecimento do genoma dos estoques cultivados de reprodutores são considerados essenciais para Aquicultura, principalmente no sentido de fornecer subsídios para o desenvolvimento de programas de manejo e melhoramento desta espécie. (AU)

Publicações científicas

(Referências obtidas automaticamente do Web of Science e do SciELO, por meio da informação sobre o financiamento pela FAPESP e o número do processo correspondente, incluída na publicação pelos autores)

HASHIMOTO, D. T.; HATA, M. E.; SATO, L. S.; JORGE, P. H.; MASTROCHIRICO-FILHO, V. A.; MARTINEZ, P.; FORESTI, F.; PORTO-FORESTI, F.. TRANSCRIPTOME CHARACTERIZATION AND SNP DISCOVERY IN SPECIES OF SERRASALMIDAE: GENETIC SUBSIDIES FOR THE BRAZILIAN AQUACULTURE. Aquaculture, v. 472, p. 1-pg., 2017-04-01. (14/05732-2, 14/12412-4, 14/03772-7)

JORGE, PAULO H.; MASTROCHIRICO-FILHO, VITO A.; HATA, MILENE E.; MENDES, NATALIA J.; ARIEDE, RAQUEL B.; DE FREITAS, MILENA VIEIRA; VERA, MANUEL; PORTO-FORESTI, FABIO; HASHIMOTO, DIOGO T.. Genetic Characterization of the Fish Piaractus brachypomus by Microsatellites Derived from Transcriptome Sequencing. FRONTIERS IN GENETICS, v. 9, FEB 22 2018. (14/05732-2, 14/03772-7)

Publicações acadêmicas

(Referências obtidas automaticamente das Instituições de Ensino e Pesquisa do Estado de São Paulo)

JORGE, Paulo Henrique. Sequenciamento do transcriptoma e caracterização de microssatélites na pirapitinga Piaractus brachypomus para análises de variabilidade genética. 2016. Dissertação de Mestrado - Universidade Estadual Paulista (Unesp). Instituto de Biociências. Botucatu Botucatu.