Análise da função de genes candidatos à manutenção da inativação do cromossomo X em humanos

• Processo: 14/26348-6
• Modalidade de apoio: Bolsas no Brasil - Mestrado
• Data de Início da vigência: 01 de abril de 2015
• Data de Término da vigência: 28 de fevereiro de 2017
• Área de conhecimento: Ciências Biológicas - Genética
• Acordo de Cooperação: Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES)
• Pesquisador responsável: Lygia da Veiga Pereira
• Beneficiário: Karla Alejandra Vizcarra Zevallos
• Instituição Sede: Instituto de Biociências (IB). Universidade de São Paulo (USP). São Paulo , SP, Brasil
• Assunto(s): Regulação da expressão gênica Epigênese genética Inativação do cromossomo X Humanos Hereditariedade
• Palavra(s)-Chave do Pesquisador: epigenética | Manutenção da XCI | reativação do cromossomo X | Regulação gênica | shRNAs | Triagem genômica funcional | epigenética

Resumo

A Inativação do Cromossomo X (XCI) em fêmeas é um exemplo de regulação epigenética. O silenciamento de um dos cromossomos X leva à formação estável da heterocromatina facultativa através da aquisição de múltiplas modificações na cromatina que são mantidas nas subsequentes divisões celulares. Os mecanismos envolvidos na iniciação e estabelecimento da XCI têm sido extensamente estudados, especialmente em camundongos. Atualmente, algumas características epigenéticas associadas à manutenção da XCI têm sido descritas, contudo os mecanismos de ação e a identidade dos diferentes fatores envolvidos na manutenção da XCI ainda são desconhecidos ou pouco compreendidos. Nosso laboratório realizou uma triagem funcional genômica por bibliotecas de shRNAs para encontrar genes envolvidos na manutenção da XCI em humanos. A partir deste estudo foram identificados 20 novos genes candidatos a estarem envolvidos na manutenção da XCI. Assim, o objetivo deste trabalho é validar 4 genes destes candidatos (SRSF10, H3F3B, ASF1A e PSKH1), analisando o grau de envolvimento destes no processo de controle epigenético do cromossomo X. Para isto, o silenciamento dos diferentes genes candidatos será realizado por meio de shRNAs específicos, em fibroblastos primários femininos com desvio total de XCI. Em seguida, a reativação do Xi nestas células será avaliada por análise de expressão alelo-específica de genes ligados ao X contendo SNPs informativos, previamente identificados no nosso laboratório. Além disso, serão realizados ensaios de RNA-FISH e trimetilação de histonas para avaliar a reativação do Xi. Por último, caso mais de um dos genes candidatos apresente um papel na manutenção do XCI, estes serão avaliados atuando em sinergismo nas células. O estudo aqui proposto vai contribuir para um melhor entendimento do processo de manutenção da XCI, e dos fatores envolvidos na herança epigenética em humanos. (AU)

Publicações acadêmicas

(Referências obtidas automaticamente das Instituições de Ensino e Pesquisa do Estado de São Paulo)

ZEVALLOS, Karla Alejandra Vizcarra. Análise da função de genes candidatos à manutenção da inativação do cromossomo X em humanos.. 2017. Dissertação de Mestrado - Universidade de São Paulo (USP). Instituto de Ciências Biomédicas (ICB/SDI) São Paulo.