Análise de dados de sequenciamento NGS (Next-Generation Sequencing): Bioinformática aplicada ao estudo de genomas e transcriptomas.

• Processo: 15/04052-0
• Modalidade de apoio: Bolsas no Brasil - Programa Capacitação - Treinamento Técnico
• Data de Início da vigência: 01 de maio de 2015
• Data de Término da vigência: 30 de junho de 2015
• Área de conhecimento: Ciências Biológicas - Genética - Genética Molecular e de Microorganismos
• Pesquisador responsável: Carlos Frederico Martins Menck
• Beneficiário: Louise Teixeira Cerdeira
• Instituição Sede: Instituto de Ciências Biomédicas (ICB). Universidade de São Paulo (USP). São Paulo , SP, Brasil
• Vinculado ao auxílio: 12/25387-2 - Estabelecimento de uma facility de sequenciamento de nova geração como ferramenta de investigação em sistemas biológicos, AP.R
• Assunto(s): Biologia computacional
• Palavra(s)-Chave do Pesquisador: bioinformática | Bioinformática

Resumo

Esta proposta prevê o desenvolvimento da estrutura de bioinformática do CEFAP, visando suprir a demanda crescente das plataformas NGS já operantes. O Centro conta atualmente com toda a infraestrutura necessária para a análise de dados de genomas pequenos, médios (até 50 Mbp) e grandes (como genomas humanos). Pretendemos que sejam realizadas atividades de apoio aos usuários quanto a análises de ressequenciamento, transcriptomas e também montagem de novo de genomas, visando a orientação das melhores abordagens experimentais e orientação quanto ao data mining e análises pós-montagens.