Gerenciamento de dados oriundos de sequenciamento NGS (Next-generation sequencing) e otimização do uso da rede interna do CEFAP.

• Processo: 15/06827-0
• Modalidade de apoio: Bolsas no Brasil - Programa Capacitação - Treinamento Técnico
• Data de Início da vigência: 01 de agosto de 2015
• Data de Término da vigência: 31 de dezembro de 2016
• Área de conhecimento: Ciências Biológicas - Genética
• Pesquisador responsável: Carlos Frederico Martins Menck
• Beneficiário: Alexandre Defelicibus
• Instituição Sede: Instituto de Ciências Biomédicas (ICB). Universidade de São Paulo (USP). São Paulo , SP, Brasil
• Vinculado ao auxílio: 12/25387-2 - Estabelecimento de uma facility de sequenciamento de nova geração como ferramenta de investigação em sistemas biológicos, AP.R
• Assunto(s): Informática Biologia computacional
• Palavra(s)-Chave do Pesquisador: Alinhamento | Informática | sequenciamento nova geração | Bioinformática

Resumo

Esta proposta prevê o desenvolvimento da estrutura de bioinformática do CEFAP, com a implementação de um sistema de gerenciamento de dados gerados pelas plataformas de sequenciamento NGS que já operam no Centro. Também pretendemos que seja realizada a otimização do acesso e análise dos dados pelos usuários de todas as core facilities, fazendo uso de toda infraestrutura já instalada e em funcionamento, como a rede de alto desempenho CEFAP-NET e servidores de bioinformática. Concomitantemente esperamos que seja possível oferecer aos usuários do Centro pipelines básicas visando auxilia pesquisadores com a manipulação e extração de informações dos dados de sequenciamento.