Geração de dados epigenômicos de gliomas e de células-tronco com base em plataformas de sequenciamento de larga escala (NGS, next generation sequencing)

• Processo: 16/06413-3
• Modalidade de apoio: Bolsas no Brasil - Programa Capacitação - Treinamento Técnico
• Data de Início da vigência: 01 de maio de 2016
• Data de Término da vigência: 30 de abril de 2017
• Área de conhecimento: Ciências da Saúde - Medicina - Clínica Médica
• Pesquisador responsável: Houtan Noushmehr
• Beneficiário: Marcos Abraão de Souza Fonseca
• Instituição Sede: Faculdade de Medicina de Ribeirão Preto (FMRP). Universidade de São Paulo (USP). Ribeirão Preto , SP, Brasil
• Vinculado ao auxílio: 15/07925-5 - Softwares de código aberto contendo ferramentas estatísticas para análise e integração de conjuntos de dados epigenômicos produzidos em alta escala, a fim de decifrar e entender redes reguladoras de câncer, AP.JP
• Assunto(s): Células-tronco Biologia computacional Sequenciamento de nova geração
• Palavra(s)-Chave do Pesquisador: bioinformática | Células-tronco | glicomas | next generation sequencing | Ngs | Bioinformática

Resumo

Esta vaga requer candidato para realizar análises de dados moleculares em larga escala (RNA/DNA), produzidos por sequenciamento de nova geração; e para auxiliar na manutenção de computadores (backups), no armazenamento e no processamento de dados. O candidato deverá ainda apoiar os pesquisadores em seus projetos, além de manter o site do laboratório.O aplicante deve ser capaz de compreender, falar e escrever na língua inglesa.

Publicações científicas

(Referências obtidas automaticamente do Web of Science e do SciELO, por meio da informação sobre o financiamento pela FAPESP e o número do processo correspondente, incluída na publicação pelos autores)

PRENDERGAST, EMILY N.; DE SOUZA FONSECA, MARCOS ABRAAO; DEZEM, FELIPE SEGATO; LESTER, JENNY; KARLAN, BETH Y.; NOUSHMEHR, HOUTAN; LIN, XIANZHI; LAWRENSON, KATE. Optimizing exosomal RNA isolation for RNA-Seq analyses of archival sera specimens. PLoS One, v. 13, n. 5, MAY 8 2018. (17/08211-1, 16/06413-3)