Estudos de diversidade microbiana no Zoo de São Paulo - apoio de bioinformática

• Processo: 16/09565-9
• Modalidade de apoio: Bolsas no Brasil - Programa Capacitação - Treinamento Técnico
• Data de Início da vigência: 01 de julho de 2016
• Data de Término da vigência: 31 de julho de 2017
• Área de conhecimento: Ciências Biológicas - Microbiologia - Microbiologia Aplicada
• Pesquisador responsável: João Carlos Setubal
• Beneficiário: Antonio Díaz Tula
• Instituição Sede: Instituto de Química (IQ). Universidade de São Paulo (USP). São Paulo , SP, Brasil
• Vinculado ao auxílio: 11/50870-6 - Estudos da diversidade microbiana no Parque Zoológico do Estado de São Paulo, AP.BTA.TEM
• Assunto(s): Compostagem Biologia computacional Alouatta Metagenômica Ecologia microbiana
• Palavra(s)-Chave do Pesquisador: Alouatta | bioinformática | Compostagem | Ecologia microbiana | metagenômica

Resumo

Este projeto tem por objetivo geral coletar, analisar e prospectar dados moleculares de três microbiomasexistentes no Parque Zoológico do Estado de São Paulo: compostagem vegetal da mata atlântica, lago, efezes de macacos bugio. A escolha destes três microbiomas contempla a diversidade de ambientes noparque e a missão de preservação de animais da Fundação PZSP. O projeto dará continuidade a outroprojeto financiado pela FAPESP (processo 2009/52030-5R) o qual focaliza somente a unidade decompostagem do parque. O projeto fará uso de diversas metodologias, sendo as principais ametagenômica por pirossequenciamento, a identificação dos isolados microbianos por espectrofotometriade massa, e bioinformática. Como resultados esperados incluem-se diversos bancos de dados, doiswebsites, uma coleção de isolados, publicações científicas de alto nível e material de divulgação paraeducação em microbiologia junto aos visitantes do parque e para ensino fundamental e médio. O projetoinclui pesquisadores da USP (campi Butantan e Zona Leste), da UNIFESP (campi Vila Clementino eDiadema), e da Fundação Parque Zoológico de São Paulo. O projeto atende à chamada do programaBIOTA-microorganismos dando ênfase aos seguintes aspectos: caracterização da biodiversidade demicroorganismos e de biomas específicos, com prospecção e o estabelecimento de coleções de linhagensmicrobianas; desenvolvimento de estratégias para a rápida identificação e transferência de linhagens compotencial de aplicação biotecnológica e industrial; e bioprospecção de produtos microbianos.O candidato à bolsa TT-5 irá dar o apoio de bioinformática ao projeto, tendo as seguintes tarefas, entre outras: download, testes e utilização de programas de terceiros para análise de dados, desenvolvimento de software para análise de dados, gerenciamento dos dados gerados no projeto, submissão de dados gerados para repositórios públicos, confecção de gráficos e tabelas para publicações, e contribuição para publicações do projeto de uma forma geral.