Modular hipertermoestável endo-beta-1,4-mananase: determinação da estrutura tridimensional do domínio central e seu papel na termoestabilização global da enzima.

• Processo: 16/15836-5
• Modalidade de apoio: Bolsas no Exterior - Estágio de Pesquisa - Doutorado
• Data de Início da vigência: 16 de janeiro de 2017
• Data de Término da vigência: 15 de janeiro de 2018
• Área de conhecimento: Ciências Biológicas - Biofísica - Biofísica Molecular
• Pesquisador responsável: Wanius José Garcia da Silva
• Beneficiário: Viviam Moura da Silva
• Supervisor: Yvain Nicolet
• Instituição Sede: Centro de Ciências Naturais e Humanas (CCNH). Universidade Federal do ABC (UFABC). Ministério da Educação (Brasil). Santo André , SP, Brasil
• Instituição Anfitriã: Institut de Biologie Structurale (IBS), França
• Vinculado à bolsa: 14/02065-5 - Modular hipertermoestável endo-beta-1,4-mananase: determinação da estrutura tridimensional do domínio central e seu papel na termoestabilização global da enzima, BP.DR
• Assunto(s): Espalhamento de raios X a baixos ângulos
• Palavra(s)-Chave do Pesquisador: biophysical studies | mannanases | Saxs | Thermotoga petrophila | three-dimensional structures | X-ray Crystallography | Estrutura e função de proteína

Resumo

A hidrólise enzimática completa dos polissacarídeos de manana requer três tipos de enzimas trabalhando sinergicamente, sendo elas: ²-mananase, ²-manosidase e ²-glicosidase. A bactéria hipertermófila Thermotoga petrophila (TpMan) produz a enzima endo-²-1,4-mananase, a qual é composta de um domínio catalítico (GH5) e um domínio de ligação ao carboidrato conectados por um linker. A estrutura tridimensional do domínio catalítico GH5 já foi determinada, entretanto, até o momento, não há estrutura tridimensional disponível para a proteína completa (TpMan). Recentemente, nós reportamos o primeiro modelo de baixa resolução para a TpMan completa e demonstramos que o linker é um domínio compacto. Neste projeto de pesquisa, como parte da continua investigação da TpMan, nós propomos determinar a estrutura tridimensional da proteína completa (TpMan) e/ou do domínio central (linker) usando cristalografia de raios X. Até o momento, não obtivemos sucesso em nossas tentativas anteriores de cristalização da proteína completa (TpMan). Assim, um estágio no exterior em um centro de pesquisa como o Institut de Biologie Structurale - Grenoble/France com grande experiência em cristalografia de raios X, deverá ser certamente importante para determinação da estrutura da TpMan.

Publicações científicas

(Referências obtidas automaticamente do Web of Science e do SciELO, por meio da informação sobre o financiamento pela FAPESP e o número do processo correspondente, incluída na publicação pelos autores)

DA SILVA, VIVIAM M.; CABRAL, ALINE D.; SPERANCA, MARCIA A.; SQUINA, FABIO M.; MUNIZ, JOAO RENATO C.; MARTIN, LYDIE; NICOLET, YVAIN; GARCIA, WANIUS. High-resolution structure of a modular hyperthermostable endo-beta-1,4-mannanase from Thermotoga petrophila: The ancillary immunoglobulin-like module is a thermostabilizing domain. BIOCHIMICA ET BIOPHYSICA ACTA-PROTEINS AND PROTEOMICS, v. 1868, n. 8, AUG 2020. (13/26096-4, 16/15836-5, 17/17275-3, 17/16291-5, 14/02065-5, 16/14514-4, 14/50897-0, 15/50590-4)