Identificação e caracterização de regiões de eucromatina associadas a regulação da expressão gênica e a gordura intramuscular em bovinos da raça nelore

• Processo: 16/13773-6
• Modalidade de apoio: Bolsas no Brasil - Mestrado
• Data de Início da vigência: 01 de outubro de 2016
• Data de Término da vigência: 28 de fevereiro de 2018
• Área de conhecimento: Ciências Agrárias - Zootecnia - Genética e Melhoramento dos Animais Domésticos
• Pesquisador responsável: Luiz Lehmann Coutinho
• Beneficiário: Natalia Silva Morosini
• Instituição Sede: Escola Superior de Agricultura Luiz de Queiroz (ESALQ). Universidade de São Paulo (USP). Piracicaba , SP, Brasil
• Vinculado ao auxílio: 12/23638-8 - Bases moleculares da qualidade da carne em bovinos da raça Nelore, AP.TEM
• Assunto(s): Genômica Regulação da expressão gênica Eucromatina Fatores de transcrição Gordura intramuscular Bos taurus indicus
• Palavra(s)-Chave do Pesquisador: Bos indicus | FAIRE-seq | gordura intramuscular | Mutações causais | Regulação gênica | Genômica

Resumo

Em eucariotos, o DNA é organizado juntamente com histonas em complexos nucleoproteicos conhecidos como nucleossomos. A cromatina apresenta-se de duas maneiras: eucromatina, região estruturalmente menos condensada e, portanto, mais facilmente transcrita e heterocromatina, região muito condensada e transcricionalmente silenciosa. Na forma de eucromatina há fácil acesso dos fatores de transcrição a regiões de DNA livres de nucleossomos enquanto, na forma de heterocromatina os fatores de transcrição não conseguem acessar o DNA para ativar ou reprimir a expressão gênica inferindo, assim, que o grau de compactação da cromatina interfere na regulação da expressão gênica e que o nucleossomo atua como silenciador gênico. Experimentos com Genome Wide-Association (GWAS) têm associado regiões de Quantitative Trait Locus (QTL) a regiões intergênicas indicando presença de mutações causais em regiões regulatórias. O objetivo do presente projeto é encontrar regiões de eucromatina que revelem sítios regulatórios no genoma de bovinos da raça Nelore e, posteriormente, correlaciona-las com regiões expression quantitative trait loci (eQTL), previamente identificadas, candidatas à regulação da deposição e composição da gordura intramuscular, do músculo Longissimus dorsi, refinando, assim, a busca por mutações causais. Este projeto é vinculado ao projeto Temático "Bases moleculares da qualidade da carne em bovinos da raça Nelore", cujos resultados contribuirão para o conhecimento da regulação da transcrição em bovinos da subespécie Bos indicus. (AU)

Publicações acadêmicas

(Referências obtidas automaticamente das Instituições de Ensino e Pesquisa do Estado de São Paulo)

MOROSINI, Natalia Silva. Identificação e caracterização de regiões de eucromatina associadas à regulação da expressão gênica e à gordura intramuscular em bovinos da raça Nelore. 2018. Dissertação de Mestrado - Universidade de São Paulo (USP). Escola Superior de Agricultura Luiz de Queiroz (ESALA/BC) Piracicaba.