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Identificação de eQTLs e estudo de regiões genômicas associadas à deposição e composição da gordura intramuscular em animais da raça Nelore

Processo: 14/22884-0
Linha de fomento:Bolsas no Exterior - Estágio de Pesquisa - Pós-Doutorado
Vigência (Início): 05 de junho de 2015
Vigência (Término): 04 de maio de 2016
Área do conhecimento:Ciências Agrárias - Zootecnia - Genética e Melhoramento dos Animais Domésticos
Pesquisador responsável:Luiz Lehmann Coutinho
Beneficiário:Aline Silva Mello Cesar
Supervisor no Exterior: James M. Reecy
Instituição-sede: Escola Superior de Agricultura Luiz de Queiroz (ESALQ). Universidade de São Paulo (USP). Piracicaba , SP, Brasil
Local de pesquisa : Iowa State University, Estados Unidos  
Vinculado à bolsa:14/11871-5 - Identificação de eQTLs e estudo de regiões genômicas associadas à deposição e composição da gordura intramuscular em animais da raça Nelore, BP.PD
Assunto(s):Bovinos de corte   Bos taurus indicus   Gado Nelore   Ácidos graxos   Polimorfismo de um único nucleotídeo   Genomas   Técnicas de genotipagem   RNA mensageiro

Resumo

A quantidade e composição da gordura intramuscular (GIM) podem influenciar as características sensoriais, o valor nutricional da carne bovina e a saúde humana, uma vez que o perfil dos seus ácidos graxos pode se apresentar de maneira diversificada conforme a genética, o manejo e a nutrição dos animais de origem. A deposição e composição da gordura são determinadas por muitos genes que participam direta ou indiretamente da adipogênese e do metabolismo lipídico. Na última década, presenciamos um grande avanço na área da genômica bovina que resultou no sequenciamento completo do genoma, no desenvolvimento de estratégias de sequenciamento de RNA para estudos de expressão gênica e chips de alta densidade de SNP para genotipagem. O objetivo deste estudo é integrar informações de genotipagem e de sequenciamento de mRNA para mapear regiões de eQTL associadas à deposição e composição de gordura intramuscular, assim como caracterizar a arquitetura genética da expressão gênica. Os dados de genotipagem (390 animais) já foram obtidos pelo presente grupo e o sequenciamento do mRNA total será obtido a partir de 200 amostras do músculo Longissimus dorsi de machos castrados da raça Nelore. As regiões de eQTL identificadas no presente projeto ampliarão o conhecimento dos mecanismos biológicos envolvidos com a biossíntese de ácidos graxos em bovinos. Estes resultados irão compor a base de dados do projeto Temático "Bases moleculares da qualidade da carne em bovinos da raça Nelore" (Processo 2012/23638-8), contribuindo para o conhecimento da regulação dos processo biológicos envolvidos com fenótipos de interesse econômico. (AU)

Publicações científicas
(Referências obtidas automaticamente do Web of Science e do SciELO, por meio da informação sobre o financiamento pela FAPESP e o número do processo correspondente, incluída na publicação pelos autores)
CESAR, ALINE S. M.; REGITANO, LUCIANA C. A.; REECY, JAMES M.; POLETI, MIRELE D.; OLIVEIRA, PRISCILA S. N.; DE OLIVEIRA, GABRIELLA B.; MOREIRA, GABRIEL C. M.; MUDADU, MAURICIO A.; TIZIOTO, POLYANA C.; KOLTES, JAMES E.; FRITZ-WATERS, ELYN; KRAMER, LUKE; GARRICK, DORIAN; BEIKI, HAMID; GEISTLINGER, LUDWIG; MOURAO, GERSON B.; ZERLOTINI, ADHEMAR; COUTINHO, LUIZ L. Identification of putative regulatory regions and transcription factors associated with intramuscular fat content traits. BMC Genomics, v. 19, JUN 27 2018. Citações Web of Science: 3.
CESAR, ALINE S. M.; REGITANO, LUCIANA C. A.; POLETI, MIRELE D.; ANDRADE, SONIA C. S.; TIZIOTO, POLYANA C.; OLIVEIRA, PRISCILA S. N.; FELICIO, ANDREZZA M.; DO NASCIMENTO, MICHELE L.; CHAVES, AMALIA S.; LANNA, DANTE P. D.; TULLIO, RYMER R.; NASSU, RENATA T.; KOLTES, JAMES E.; FRITZ-WATERS, ERIC; MOURAO, GERSON B.; ZERLOTINI-NETO, ADHEMAR; REECY, JAMES M.; COUTINHO, LUIZ L. Differences in the skeletal muscle transcriptome profile associated with extreme values of fatty acids content. BMC Genomics, v. 17, NOV 22 2016. Citações Web of Science: 8.

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