Determinação estrutural dos peptídeos de fusão da SARS por espectroscopia de ressonância magnética nuclear no estado sólido

• Processo: 16/24452-6
• Modalidade de apoio: Bolsas no Exterior - Estágio de Pesquisa - Pós-Doutorado
• Data de Início da vigência: 01 de março de 2017
• Data de Término da vigência: 28 de fevereiro de 2018
• Área de conhecimento: Ciências Biológicas - Biofísica - Biofísica Molecular
• Pesquisador responsável: Antonio José da Costa Filho
• Beneficiário: Luís Guilherme Mansor Basso
• Supervisor: Stanley J. Opella
• Instituição Sede: Faculdade de Filosofia, Ciências e Letras de Ribeirão Preto (FFCLRP). Universidade de São Paulo (USP). Ribeirão Preto , SP, Brasil
• Instituição Anfitriã: University of California, San Diego (UC San Diego), Estados Unidos
• Vinculado à bolsa: 14/00206-0 - Estrutura e função dos peptídeos de fusão da glicoproteína spike do SARS-CoV, BP.PD
• Assunto(s): Vírus da SARS Síndrome respiratória aguda grave Proteínas de fusão de membrana Proteínas virais Proteínas virais de fusão Glicoproteína da espícula de Coronavirus Espectroscopia de ressonância magnética nuclear
• Palavra(s)-Chave do Pesquisador: Fusion peptides | Lipid bilayer membranes | Sars | Solid State NMR | viral membrane fusion | Espectroscopia de Ressonância Magnética

Resumo

A presente proposta de pesquisa é uma extensão da bolsa FAPESP de pós-doutorado de Luís Basso e visa descrever as atividades a serem realizadas pelo candidato durante sua estadia proposta de um ano na Universidade da Califórnia em San Diego (UCSD), sob a supervisão do Prof. Dr. Stanley Opella, um reconhecido líder internacional no campo de determinação estrutural de proteínas de membrana por espectroscopia de ressonância magnética nuclear no estado sólido (ssNMR). Devido às dificuldades inerentes na obtenção de informações estruturais em resolução atômica de peptídeos e proteínas de membrana incorporados em bicamadas lipídicas, iremos nos valer da experiência do Prof. Opella para trabalhar com os peptídeos de fusão (FP) da glicoproteína Spike do SARS-CoV em modelos de membranas biológicas. Em recente artigo publicado na revista Nature Scientific Reports, mostramos que os FPs do SARS-CoV promovem desidratação parcial e curvatura em bicamadas lipídicas, permitindo-nos elucidar alguns dos passos do complexo e orquestrado mecanismo de fusão mediado pela glicoproteína viral. No entanto, tanto a conformação ativa do peptídeo de fusão quanto sua topologia em bicamadas lipídicas assim como os detalhes moleculares do processo de indução de curvatura e desidratação da membrana ainda não são conhecidos. Portanto, o presente projeto tem como objetivo a obtenção de informações com detalhe atômico da estrutura, orientação e grau de inserção dos FPs da SARS em bicamadas lipídicas e em condições fisiológicas usando métodos modernos de ssNMR de alta resolução. Essas informações serão essenciais para entender o mecanismo de ação dos peptídeos, uma vez que existe uma alta correlação entre a estrutura secundária e a profundidade de inserção na membrana com a atividade fusogênica dos FPs.