| Processo: | 16/11039-3 |
| Modalidade de apoio: | Bolsas no Brasil - Doutorado |
| Data de Início da vigência: | 01 de abril de 2017 |
| Data de Término da vigência: | 29 de fevereiro de 2020 |
| Área de conhecimento: | Ciências da Saúde - Medicina - Clínica Médica |
| Pesquisador responsável: | Houtan Noushmehr |
| Beneficiário: | Maritza Queiroz Salas Mosella |
| Instituição Sede: | Faculdade de Medicina de Ribeirão Preto (FMRP). Universidade de São Paulo (USP). Ribeirão Preto , SP, Brasil |
| Vinculado ao auxílio: | 15/07925-5 - Softwares de código aberto contendo ferramentas estatísticas para análise e integração de conjuntos de dados epigenômicos produzidos em alta escala, a fim de decifrar e entender redes reguladoras de câncer, AP.JP |
| Bolsa(s) vinculada(s): | 17/10357-4 - Análise Compreensiva e Integrativa do Metiloma de Tumores Endócrinos que apresentam o Fenótipo de Hipermetilação de Ilhas CpG (CIMP), BE.EP.DR |
| Assunto(s): | Biologia computacional Expressão gênica Metilação de DNA |
| Palavra(s)-Chave do Pesquisador: | bioinformatics | DNA methylation | Endocrine | Epigenomics | gene expression | Histone modifications | Bioinformatica |
Resumo A metilação do DNA é um processo envolvido na estabilidade genética, organização genômica e desenvolvimento e tem sido associado com várias doenças, tais como o câncer. Nos canceres, a hipometilação geral do genoma em regiões não-promotoras e hipermetilação em ilhas CpG são observadas, sendo responsáveis pela super expressão de oncogenes e silenciamento de genes supressores tumorais, respectivamente. De acordo com a metilação diferencial do DNA, o câncer coloretal foi descrito como portador do fenótipo de ilhas CpG metiladas (CIMP), caracterizado por hipermetilação generalizada de ilhas CpG. O fenótipo CIMP foi descrito, no entanto em uma miríade de tumores. Dentre os mais consolidados, o adrenal (A-CIMP), o de mama (B-CIMP, do inglês "breast"), o coloretal (C-CIMP) e os gliomas (G-CIMP) serão o foco deste trabalho. Apesar de apresentar semelhanças entre tumores, o fenótipo CIMP aponta para características específicas em cada tumor, estando relacionado com bom e mau prognósticos. Dr. Noushmehr e colegas definiram pela primeira vez o G-CIMP e, recentemente, dois novos subgrupos de G-CIMP, denominados G-CIMP alto e G-CIMP baixo, subclassificação que também se aplica a outros tipos de tumores. Além do impacto de regiões promotoras, regiões reguladoras distais tais como enhancers e silenciadores desempenham um papel importante no controle da expressão gênica. Estudos recentes com C-CIMP apontam para interatomas proteína-proteína como biomarcadores para delinear os fenótipos CIMP/não-CIMP. Apesar do fenótipo CIMP ter sido amplamente explorado, a relação entre ele e elementos reguladores do genoma permanece por ser elucidado. No presente estudo pretendemos realizar uma análise "ômica" integrativa entre tumores CIMP, focando, além das regiões promotoras hipermetiladas, nas regiões não-promotoras. | |
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