RNAs não codificantes em ascídias coloniais

• Processo: 17/13758-0
• Modalidade de apoio: Bolsas no Brasil - Mestrado
• Data de Início da vigência: 01 de setembro de 2017
• Data de Término da vigência: 31 de julho de 2019
• Área de conhecimento: Ciências Biológicas - Zoologia - Morfologia dos Grupos Recentes
• Acordo de Cooperação: ANR
• Pesquisador responsável: Federico David Brown Almeida
• Beneficiário: David dos Santos Soares
• Instituição Sede: Instituto de Biociências (IB). Universidade de São Paulo (USP). São Paulo , SP, Brasil
• Vinculado ao auxílio: 15/50164-5 - Células-tronco, brotação e a evolução da colonialidade em ascídias, AP.JP
• Assunto(s): Biologia do desenvolvimento RNA não traduzido
• Palavra(s)-Chave do Pesquisador: Ascídias coloniais | RNAs não codificantes | Biologia do desenvolvimento

Resumo

Uma abordagem genômica comparativa foi lançada no laboratório em colaboração com o Laboratório de Bermúdez (Colômbia) e o estudo do Laboratório Tiozzo (França), a fim de compreender melhor a evolução da transição de história de vida em cordados marinhos, em particular a transição evolutiva de propagação sexual para a assexual. A dimensão e a complexidade do genoma relacionadas com a evolução da colonialidade como uma história de vida continua a ser explorada e, em um espectro de interesse mais amplo, esperamos levantar questões novas e originais sobre como a evolução de diferentes estratégias reprodutivas poderia moldar a estrutura de um genoma .Um interesse recente em pesquisa de nosso laboratório em colaboração com Clara Bermúdez (Universidade Nacional, Bogotá) é explorar a evolução dos RNAs não codificantes em ascidians coloniais. Em particular, microRNAs e os RNAs não codificantes de cadeia longa regulam a manutenção, o comprometimento ou o destino das linhagens de células-tronco progenitoras. Os RNAs não codificantes podem revelar mecanismos regulatórios específicos de importantes caminhos de desenvolvimento envolvidos na reprodução de brotos ou clonais? Em que medida as mudanças nos genes relacionados aos RNAs não codificantes podem afetar a evolução de novas histórias de vida em animais? Para responder a estas questões, propomos gerar predições e validações de genes de RNA não codificante para todos os genomas de ascídias da família Styelidae em colaboração com Clara Bermúdez na Universidade Nacional de Colômbia, Bogotá e Arjan Gittenberger (GIMARIS, Amsterdã). Por homologia e estrutura, já havíamos previsto a existência e possíveis funções dos RNAs não codificantes nos genomas das espécies coloniais Botryllus schlosseri e Didemnum vexillum e os comparamos com genomas de tunicados solitários, incluindo Ciona spp., Molgula spp. e Oikopleura dioica. Esses estudos comparativos já geraram um punhado de RNAs não codificantes candidatos, incluindo os assim chamados Incomirs (micro RNAs oncogênicos) envolvidos na função de células estaminais de câncer, ou snRNAs e snoRNAs envolvidos no processamento de RNA, que precisam ser validados para funções celulares relacionadas à regeneração ou brotação em ascídias coloniais (não publicados). Uma visão geral dos RNAs não codificantes em um contexto filogenético mais amplo nos permitirá entender como esses genes mudam, duplicam, surgem de novo ou se perdem durante a evolução da transição da condição solitária para a colonial (AU)

Publicações acadêmicas

(Referências obtidas automaticamente das Instituições de Ensino e Pesquisa do Estado de São Paulo)

SOARES, David dos Santos. Padrões de localização celular de proteínas da linhagem germinativa em tunicados solitários e coloniais. 2019. Dissertação de Mestrado - Universidade de São Paulo (USP). Instituto de Biociências (IBIOC/SB) São Paulo.