Estrutura computacional, caderno de anotações eletrônico e construção da base de dados

• Processo: 17/17575-7
• Modalidade de apoio: Bolsas no Brasil - Programa Capacitação - Treinamento Técnico
• Data de Início da vigência: 01 de outubro de 2017
• Data de Término da vigência: 31 de julho de 2019
• Área de conhecimento: Interdisciplinar
• Acordo de Cooperação: CNPq - INCTs
• Pesquisador responsável: Paulo Arruda
• Beneficiário: Lucas Martins Ferreira
• Instituição Sede: Instituto de Biologia (IB). Universidade Estadual de Campinas (UNICAMP). Campinas , SP, Brasil
• Vinculado ao auxílio: 14/50897-0 - INCT 2014: Centro de Química Medicinal de Acesso Aberto, AP.TEM
• Assunto(s): Bases de dados Mineração de dados Biologia computacional
• Palavra(s)-Chave do Pesquisador: caderno de anotações eletrônico | Estrutura computacional | ferramenta de bioinformática | Scarab | Bioinformática

Resumo

Nosso projeto INCT irá gerar uma larga quantidade de dados incluindo os critérios para a escolha de proteínas alvo para informações biológicas, mas também de caracterização experimental e integração de dados. O projeto INCT irá utilizar um caderno de anotações eletrônico denominado Scarab, onde todas as informações cientificas são inseridas diariamente e compartilhadas entre todos os pesquisadores envolvidos. Este profissional precisará de experiência em manipulação de bases de dados, além de migração através de diferentes bases de dados. É também esperado conhecimento na área de bioinformática, relacionados com a evolução de famílias proteicas especificas. Uma vez que nos necessitaremos realizar a anotação de estruturas de genes para as proteínas a serem estudadas. Na gestão do projeto computacional o objetivo é a organização da informação, compartilhamento entre os grupos de pesquisadores, ajudar a manter o web site. No âmbito cientifico é esperado que seja realizado o mapeamento de sistemas biológicos para as proteínas de interesse. A questão inicial focará em um conjunto de cinco proteínas neurais requerendo o desenvolvimento de soluções criativas de mineração de dados. Isto integrará dados de mutações, transcriptoma, interactoma e atividades proteicas. O trabalho irá requerer pesquisador independente com nível de doutorado devido à complexidade do projeto. O TT5 também irá treinar cientistas juniores. (AU)