Caracterização de novos elementos regulatórios metagenômicos

• Processo: 17/20818-9
• Modalidade de apoio: Bolsas no Brasil - Iniciação Científica
• Data de Início da vigência: 01 de janeiro de 2018
• Data de Término da vigência: 30 de junho de 2018
• Área de conhecimento: Ciências Biológicas - Microbiologia
• Pesquisador responsável: María Eugenia Guazzaroni
• Beneficiário: Tiago Cabral Borelli
• Instituição Sede: Faculdade de Filosofia, Ciências e Letras de Ribeirão Preto (FFCLRP). Universidade de São Paulo (USP). Ribeirão Preto , SP, Brasil
• Vinculado ao auxílio: 15/04309-1 - Novas abordagens para melhorar a prospecção funcional de biocatalizadores em bibliotecas metagenômicas, AP.JP
• Assunto(s): Expressão gênica Regulação da expressão gênica Fatores de transcrição Transcrição genética Metagenômica Biologia sintética
• Palavra(s)-Chave do Pesquisador: Fatores transcrição | Metagenômica Funcional | Promotores | Regulação gênica bacteriana | Metagenômica Funcional

Resumo

Compreender a expressão gênica em bactérias é fundamental para entender a lógica de tomada de decisão bacterianas, fornece ferramentas para Biologia Sintética e estudar a regulação da expressão gênica em comunidades microbianas. Em procariotos existem dois principais níveis no controle no início da transcrição. O primeiro são os fatores sigma (Ã) que dão especificidade à RNA polimerase guiando-a para determinados promotores; depois estão os fatores de transcrição (FT) que promovem ou reprimem a transcrição, formando um fino mecanismo de controle. O presente projeto tem como objetivo caracterizar a influência dos sigmas Ã70(RpoD), Ã38(RpoS) e Ã32(RpoH) e dos fatores de transcrição CRP e IHF sobre promotores metagenômicos usando cepas mutantes RpoS, RpoS, RpoH, CRP, IHF e selvagens wtRpoS, wtRpoS wtRpoH, wtCRP, wtIHF. Nossos resultados preliminares indicam que é de fundamental importância que as medições sejam feitas na fase estacionária da curva de crescimento bacteriano para garantir a presenta de Ã38(RpoS), inerente a esse período, bem como impedir viés imposto pela diferença de crescimento das cepas MC4100 (wtRpoH) e K16 (RpoH) antes da fase estacionária (AU)

Publicações científicas

(4)

(Referências obtidas automaticamente do Web of Science e do SciELO, por meio da informação sobre o financiamento pela FAPESP e o número do processo correspondente, incluída na publicação pelos autores)

ALVES, LUANA DE FATIMA; BORELLI, TIAGO CABRAL; WESTMANN, CAUA ANTUNES; SILVA-ROCHA, RAFAEL; GUAZZARONI, MARIA-EUGENIA. Boundaries in metagenomic screenings using lacZ alpha-based vectors. GENETICS AND MOLECULAR BIOLOGY, v. 43, n. 1, 2020. (15/04309-1, 16/05472-6, 17/20818-9, 16/06323-4)

ALVES, LUANA DE FATIMA; WESTMANN, CAUA ANTUNES; LOVATE, GABRIEL LENCIONI; VIANA DE SIQUEIRA, GUILHERME MARCELINO; BORELLI, TIAGO CABRAL; GUAZZARONI, MARIA-EUGENIA. Metagenomic Approaches for Understanding New Concepts in Microbial Science. INTERNATIONAL JOURNAL OF GENOMICS, v. 2018, p. 15-pg., 2018-01-01. (17/20818-9, 16/05472-6, 16/06323-4, 15/04309-1)

LUANA DE FÁTIMA ALVES; TIAGO CABRAL BORELLI; CAUÃ ANTUNES WESTMANN; RAFAEL SILVA-ROCHA; MARÍA-EUGENIA GUAZZARONI. Boundaries in metagenomic screenings using lacZα-based vectors. GENETICS AND MOLECULAR BIOLOGY, v. 43, n. 1, 2020-03-06. (16/06323-4, 17/20818-9, 16/05472-6, 15/04309-1)

ALVES, LUANA DE FATIMA; WESTMANN, CAUA ANTUNES; LOVATE, GABRIEL LENCIONI; VIANA DE SIQUEIRA, GUILHERME MARCELINO; BORELLI, TIAGO CABRAL; GUAZZARONI, MARIA-EUGENIA. Metagenomic Approaches for Understanding New Concepts in Microbial Science. INTERNATIONAL JOURNAL OF GENOMICS, 2018. (16/06323-4, 15/04309-1, 16/05472-6, 17/20818-9)