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Disenho baseado em estrutura de inhibidores alostéricos e competitivos da cruzaína

Processo: 18/03911-8
Modalidade de apoio:Bolsas no Brasil - Doutorado
Data de Início da vigência: 01 de maio de 2018
Data de Término da vigência: 31 de maio de 2022
Área de conhecimento:Ciências Biológicas - Biofísica - Biofísica Molecular
Pesquisador responsável:Fátima Pereira de Souza
Beneficiário:Lilian Hernández Alvarez
Instituição Sede: Instituto de Biociências, Letras e Ciências Exatas (IBILCE). Universidade Estadual Paulista (UNESP). Campus de São José do Rio Preto. São José do Rio Preto , SP, Brasil
Bolsa(s) vinculada(s):18/25311-2 - Caracterização e otimização farmacológica de novos compostos naturais com atividade anti-chagásica, BE.EP.DR
Assunto(s):Modelagem molecular   Cruzaína   Trypanosoma cruzi   Doença de Chagas   Atividade enzimática   Inibidores de cisteína proteinase
Palavra(s)-Chave do Pesquisador:binding free energy | cruzain | cysteine protease inhibitors | molecular dynamics | Nmr | virtual screening | Modelagem molecular

Resumo

Trypanosoma cruzi é o agente causal da doença de Chagas, uma infecção negligenciada que afeta milhões de pessoas nas regiões tropicais. A maioria dos fármacos empregados no tratamento desta doença são ineficientes e altamente tóxicos. A cruzaína é a principal cisteíno protease do T. cruzi. Esta enzima é indispensável para a sobrevivência e propagação do parasita e, portanto, é considerada como um alvo molecular para o desenho de fármacos contra a doença de Chagas. Até o momento, vários estudos experimentais e computacionais têm caracterizado o sítio de união ao substrato e a especificidade da cruzaína, o que facilita o desenho de fármacos específicos contra o sítio ativo da enzima. Na atualidade, o descobrimento de inibidores alostéricos é um tópico emergente dentro da área de desenho computacional de fármacos, pois promove a acessibilidade a medicamentos mais seletivos e menos tóxicos. Portanto, neste trabalho será empregada uma estratégia para a descoberta computacional de inibidores competitivos e alostéricos da cruzaína. A combinação de técnicas como a triagem virtual, simulações de dinâmica molecular, cálculos de energia livre de ligação e a construção de redes de interações entre resíduos será empregada para selecionar os potenciais inibidores da cruzaína e para a caracterização molecular da forma livre e ligada desta protease. Como última estapa, serão realizados experimentos de RMN e ensaios de atividade enzimática que permitirão a caracterização das interações entre a cruzaína e os ligantes identificados, além de fornecer os dados das constantes de inibição. De pose de estes resultados, pretendese validar o mecanismo de alostería previamente proposto.

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Publicações científicas (7)
(As publicações científicas contidas nesta página são originárias da Web of Science ou da SciELO, cujos autores mencionaram números dos processos FAPESP concedidos a Pesquisadores Responsáveis e Beneficiários, sejam ou não autores das publicações. Sua coleta é automática e realizada diretamente naquelas bases bibliométricas)
HERNANDEZ GONZALEZ, JORGE ENRIQUE; ALVAREZ, LILIAN HERNANDEZ; PASCUTTI, PEDRO GERALDO; LEITE, VITOR B. P.. Prediction of Noncompetitive Inhibitor Binding Mode Reveals Promising Site for Allosteric Modulation of Falcipain-2. Journal of Physical Chemistry B, v. 123, n. 34, SI, p. 7327-7342, . (16/24587-9, 18/03911-8)
HERNANDEZ-ALVAREZ, LILIAN; OLIVEIRA JR, ANTONIO B.; HERNANDEZ-GONZALEZ, JORGE ENRIQUE; CHAHINE, JORGE; PASCUTTI, PEDRO GERALDO; DE ARAUJO, ALEXANDRE SUMAN; DE SOUZA, FATIMA PEREIRA. . COMPUTATIONAL AND STRUCTURAL BIOTECHNOLOGY JOURNAL, v. 19, p. 2027-2044, . (10/18169-3, 16/24587-9, 18/03911-8)
GONZALEZ, JORGE ENRIQUE HERNANDEZ; ALVAREZ, LILIAN HERNANDEZ; LEITE, VITOR B. P.; PASCUTTI, PEDRO GERALDO. . JOURNAL OF CHEMICAL INFORMATION AND MODELING, v. 60, n. 11, p. 5499-5512, . (16/24587-9, 18/25311-2, 18/03911-8)
ALVAREZ, LILIAN HERNANDEZ; BARRETO GOMES, DIEGO ENRY; HERNANDEZ GONZALEZ, JORGE ENRIQUE; PASCUTTI, PEDRO GERALDO. . PLoS One, v. 14, n. 1, . (16/24587-9, 18/03911-8)
DA SILVA, ELANY BARBOSA; SHARMA, VANDNA; HERNANDEZ-ALVAREZ, LILIAN; TANG, ARTHUR H.; STOYE, ALEXANDER; O'DONOGHUE, ANTHONY J.; GERWICK, WILLIAM H.; PAYNE, RICHARD J.; MCKERROW, JAMES H.; PODUST, LARISSA M.. . Journal of Medicinal Chemistry, v. 65, n. 5, p. 15-pg., . (18/25311-2, 18/03911-8)
HERNANDEZ GONZALEZ, JORGE ENRIQUE; SALAS-SARDUY, EMIR; HERNANDEZ ALVAREZ, LILIAN; BARRETO GOMES, DIEGO ENRY; PASCUTTI, PEDRO GERALDO; OOSTENBRINK, CHRIS; LEITE, VITOR B. P.. . Journal of Computer-Aided Molecular Design, v. 35, n. 10, p. 1067-1079, . (16/24587-9, 20/10214-1, 16/19766-1, 18/03911-8, 19/22540-3)
HERNANDEZ GONZALEZ, JORGE ENRIQUE; ALVAREZ, LILIAN HERNANDEZ; PASCUTTI, PEDRO GERALDO; LEITE, VITOR B. P.. . Journal of Physical Chemistry B, v. 123, n. 34, p. 16-pg., . (18/03911-8, 16/24587-9)
Publicações acadêmicas
(Referências obtidas automaticamente das Instituições de Ensino e Pesquisa do Estado de São Paulo)
ALVAREZ, Lilian Hernández. Estudos estruturais e computacionais de proteínas alvos de doenças negligenciadas para a descoberta de novos fármacos. 2022. Tese de Doutorado - Universidade Estadual Paulista (Unesp). Instituto de Biociências Letras e Ciências Exatas. São José do Rio Preto São José do Rio Preto.