Uso de simulações em seleção genômica para avanços em programas de melhoramento de seringueira

• Processo: 18/14305-1
• Modalidade de apoio: Bolsas no Exterior - Estágio de Pesquisa - Doutorado Direto
• Data de Início da vigência: 01 de novembro de 2018
• Data de Término da vigência: 31 de outubro de 2019
• Área de conhecimento: Ciências Biológicas - Genética - Genética Vegetal
• Pesquisador responsável: Anete Pereira de Souza
• Beneficiário: Luciano Henrique Braz dos Santos
• Supervisor: John Micheal Hickey
• Instituição Sede: Centro de Biologia Molecular e Engenharia Genética (CBMEG). Universidade Estadual de Campinas (UNICAMP). Campinas , SP, Brasil
• Instituição Anfitriã: University of Edinburgh, Escócia
• Vinculado à bolsa: 17/07908-9 - Análises genéticas e genômicas no gênero Hevea visando contribuir para o melhoramento genético de Hevea brasiliensis, BP.DD
• Assunto(s): Melhoramento genético vegetal Polimorfismo de um único nucleotídeo Seleção genômica Seringueira Hevea brasiliensis
• Palavra(s)-Chave do Pesquisador: Gbs | melhoramento | selecao genomica | seringueira | SNPs | Melhoramento de Plantas

Resumo

A seringueira (Hevea brasiliensis) é a principal fonte comercial de borracha natural, utilizada em diversos produtos, incluindo pneus e dispositivos médicos. Apesar de sua importância, esta árvore apresenta um longo ciclo de geração, o que explica o lento progresso no melhoramento, geralmente 30 anos por ciclo usando métodos tradicionais. Considerando o tempo de reprodução, qualquer ferramenta que reduza esse tempo, como a seleção assistida por marcadores, pode representar uma vantagem para a cultura. Com o desenvolvimento da tecnologia de sequenciamento de próxima geração, o custo dos métodos de sequenciamento de DNA diminuiu, tornando possível o uso da genotipagem por sequenciamento (GBS) em muitos estudos. A seleção genômica pode reduzir o tempo de melhoramento da seringueira usando equações de predição com parâmetros baseados em indivíduos genotipados e fenotipados para predizer os valores nos indivíduos que são candidatos à seleção e que possuem apenas dados genotípicos, evitando assim o longo tempo de fenotipagem utilizado para esta seleção. Resultados preliminares foram gerados no projeto de doutorado (2017/07908-9)m utilizando métodos GBS em estudos de desequilíbrio de ligação, possibilitando a utilização deste conjunto de dados para simular ciclos de seleção genômica e compará-los com os métodos tradicionais de melhoramento utilizados nesta cultura. Para analisar tais dados ou utilizar simulações, é de vital importância que se ocorra a colaboração com um grupo de pesquisa que tenha experiência no uso de simulações para a criação de um melhor programa de melhoramento genético com seleção genômica. (AU)