Taxonomia molecular e caracterização genômica de genes regulados por vias de Quorum Sensing em isolados de bactérias láticas oriundas de diferentes matrizes alimentares

• Processo: 18/26719-5
• Modalidade de apoio: Bolsas no Exterior - Estágio de Pesquisa - Doutorado Direto
• Data de Início da vigência: 05 de setembro de 2019
• Data de Término da vigência: 04 de março de 2020
• Área de conhecimento: Ciências Biológicas - Microbiologia
• Pesquisador responsável: Elaine Cristina Pereira de Martinis
• Beneficiário: Otávio Guilherme Gonçalves de Almeida
• Supervisor: Giovanna Felis
• Instituição Sede: Faculdade de Ciências Farmacêuticas de Ribeirão Preto (FCFRP). Universidade de São Paulo (USP). Ribeirão Preto , SP, Brasil
• Instituição Anfitriã: Università degli Studi di Verona, Itália
• Vinculado à bolsa: 17/13759-6 - Prospecção metagenômica de bactérias relacionadas a quorum sensing durante a fermentação espontânea do cacau, BP.DD
• Assunto(s): Microbiologia de alimentos Bactérias ácido lácticas Fermentação Cacau Biologia computacional Percepção de Quorum
• Palavra(s)-Chave do Pesquisador: bioinformatics | food fermentation | Lactic acid bacteria | quorum sensing | Whole-genome sequencing | Microbiologia de Alimentos

Resumo

As bactérias do ácido láctico (LAB) compõem um grupo parafilético que está relacionado a várias matrizes alimentares. Na fermentação espontânea de cacau, as LAB formam o principal grupo de bactérias envolvido em todo o processo de fermentação. O Projeto de doutorado direto fomentado pela FAPESP (Número 17/13759-6) busca entender a influência do Quorum Sensing (QS) na fermentação do cacau e visa desenvolver um coquetel bacteriano definido para padronizar a fermentação, selecionando linhagens LAB cuja atividade de QS foi detectada. A abordagem taxonômica para caracterizar os isolados LAB é muito importante porque é fundamental para relacionar a cepa à sua origem, habitat e fisiologia, o que impacta diretamente na seleção de novos microrganismos candidatos para aplicações em fermentações industriais padronizadas. Por outro lado, como as LAB são bem reconhecidas por possuírem Sistemas de QS de dois componentes (QS-TCSs), que são sistemas-chave em vias QS, uma análise genômica das LAB através do Sequenciamento do Genoma Completo (WGS) será útil para identificar in silico as sequências codificadoras putativas relacionadas a estes QS-TCSs, o que acarretará em vantagens para: (i) para projetar a cultura inicial proposta no projeto 17 / 13759-6 e, (ii) para comparar o esquema de taxonomia LAB com base em marcadores filogenéticos com as sequências de marcadores inteiras recuperadas dos genomas LAB montados. (AU)