Bioprospecção microbiana acelerada através de abordagem MATRIX-GNPS

• Processo: 19/09350-0
• Modalidade de apoio: Bolsas no Exterior - Estágio de Pesquisa - Pós-Doutorado
• Data de Início da vigência: 20 de agosto de 2019
• Data de Término da vigência: 19 de agosto de 2020
• Área de conhecimento: Ciências Exatas e da Terra - Química - Química Orgânica
• Pesquisador responsável: Marcelo José Pena Ferreira
• Beneficiário: Marcelo Marucci Pereira Tangerina
• Supervisor: Robert John Capon
• Instituição Sede: Instituto de Biociências (IB). Universidade de São Paulo (USP). São Paulo , SP, Brasil
• Instituição Anfitriã: University of Queensland, Brisbane (UQ), Austrália
• Vinculado à bolsa: 17/16606-6 - Actinomicetos das ilhas do Brasil: uma abordagem metabolômica na bioprospecção de produtos naturais com potencial antitumoral, BP.PD
• Assunto(s): Química de produtos naturais Resistência microbiana a medicamentos Produtos naturais marinhos Actinomycetales
• Palavra(s)-Chave do Pesquisador: Actinomicetos | Produtos Naturais Marinhos | resistência microbiana | Química de Produtos Naturais

Resumo

As condições ambientais conduzem adaptações no metabolismo secundário microbiano, que codifica uma infinidade de clusters gênicos biossintéticos (BGCs). Descobertas genômicas revelam que a maioria dos BGCs é silenciosa (inativa) e abrigam uma incrível diversidade química ainda a ser explorada. Com o aumento da resistência aos antibióticos, a necessidade de novos medicamentos nunca foi tão urgente. Este projeto visa utilizar condições modernas de cultivo para ativar transcricionalmente BGCs silenciosos, a fim de induzir a produção de novos metabólitos por cepas raras de actinomicetos. Para este propósito, será utilizada uma combinação de uma abordagem miniaturizada de cultivo microbiano de alto rendimento (MATRIX) e redes moleculares (GNPS), juntamente com avaliação antimicrobiana frente à cepas resistentes a antibióticos e ensaios de citotoxicidade. Após seleção das cepas e parâmetros de cultivo mais promissores, serão realizadas fermentações em larga escala, fracionamento dos extratos e isolamento de compostos. Esta abordagem utiliza uma metodologia rápida e econômica para a obtenção de novas substâncias bioativas.