Parâmetros genéticos e estudo de associação genômica ampla para características lineares de conformação, facilidade de ordenha e temperamento em Gir leiteiro

• Processo: 19/09736-6
• Modalidade de apoio: Bolsas no Exterior - Estágio de Pesquisa - Mestrado
• Data de Início da vigência: 01 de agosto de 2019
• Data de Término da vigência: 31 de janeiro de 2020
• Área de conhecimento: Ciências Agrárias - Zootecnia - Genética e Melhoramento dos Animais Domésticos
• Pesquisador responsável: Danísio Prado Munari
• Beneficiário: Samla Marques Freire Cunha
• Supervisor: Flavio Schramm Schenkel
• Instituição Sede: Faculdade de Ciências Agrárias e Veterinárias (FCAV). Universidade Estadual Paulista (UNESP). Campus de Jaboticabal. Jaboticabal , SP, Brasil
• Instituição Anfitriã: University of Guelph, Canadá
• Vinculado à bolsa: 18/23664-5 - Parâmetros genéticos e estudo de associação genômica ampla para características lineares de conformação, facilidade de ordenha e temperamento em Gir leiteiro, BP.MS
• Assunto(s): Bovinocultura leiteira Gado Gir Estudo de associação genômica ampla Polimorfismo de um único nucleotídeo
• Palavra(s)-Chave do Pesquisador: Bayesian methodology | genetic correlation | Gwas | heritability | Snp | ssGBLUP | Melhoramento Genético de bovinos de leite

Resumo

A bovinocultura leiteira tem como principal objetivo o aumento da produção de leite e redução dos gastos com o descarte de animais nos rebanhos. Com o intuito de atender a esses objetivos, as características lineares de conformação, facilidade de ordenha e temperamento podem ser utilizadas para auxiliar na seleção de reprodutores mais produtivos, com melhor conformação corporal e de fácil manejo. O objetivo desse estudo visa verificar se na raça Gir é possível modificar as características lineares de conformação do sistema mamário (úbere anterior, úbere posterior, profundidade de úbere, comprimento dos tetos e diâmetro dos tetos), de pernas e pés (ângulo dos cascos, posição das pernas pela vista lateral, abertura das pernas visto por trás), de dimensão corporal (perímetro torácico, comprimento do corpo, comprimento do umbigo, comprimento da garupa, altura de garupa, ângulo de garupa, largura dos ísquios e largura entre os ílios) de facilidade de ordenha e temperamento por meio de seleção e como estas características interferem com a produção de leite. Além disso, pretende-se avaliar as possíveis associações entre polimorfismos de nucleotídeo único (SNPs) com essas características. Serão utilizados dados pertencentes ao Programa Nacional de Melhoramento do Gir Leiteiro (PNMGL), disponibilizados pela Embrapa Gado de Leite. Para as características estudadas, o modelo animal proposto incluirá os efeitos fixos e os efeitos aleatórios genético aditivo, ambiente permanente de animal e residual. Para as características lineares de conformação, facilidade de ordenha e temperamento os efeitos fixos serão, a princípio, o grupo de contemporâneas (fazenda e época de avaliação), ano de avaliação, avaliador, tratamento preferencial e covariável idade da vaca à avaliação. Para produção de leite os efeitos fixos serão grupo de contemporâneas (fazenda e ano de parto), época de parto, tratamento preferencial e covariável idade ao parto. Serão realizadas análises uni e bicaracterísticas para a obtenção das estimativas dos parâmetros genéticos de animal, utilizando a metodologia bayesiana. Para o estudo de associação ampla do genoma será utilizada a metodologia de single-step GBLUP (ssGBLUP). Os genes incluídos nas regiões significativas serão identificados utilizando o genoma do Bos taurus taurus, presente no Genome Data Viewer do NCBI e em seguida, será realizado o enriquecimento gênico utilizando o software DAVID.