| Processo: | 19/14878-4 |
| Modalidade de apoio: | Bolsas no Brasil - Mestrado |
| Data de Início da vigência: | 01 de novembro de 2019 |
| Data de Término da vigência: | 31 de outubro de 2021 |
| Área de conhecimento: | Ciências Biológicas - Genética - Genética Animal |
| Pesquisador responsável: | Maria Dulcetti Vibranovski |
| Beneficiário: | Isabela Pimentel de Almeida |
| Instituição Sede: | Instituto de Biociências (IB). Universidade de São Paulo (USP). São Paulo , SP, Brasil |
| Vinculado ao auxílio: | 15/20844-4 - O Papel da Gametogênesis na Origem e Evolução dos Genes Novos, AP.JP |
| Assunto(s): | Biologia computacional Genômica Espermatogênese Cromossomo Y Heterocromatina |
| Palavra(s)-Chave do Pesquisador: | bioinformática | espermatogênese | sequência repetitiva | Genômica Evolutiva e Bioinformática |
Resumo Pesquisas que focam no entendimento da sequência e organização da heterocromatina permitem que funções essenciais para o organismo como um todo sejam melhor compreendidas. Um dos principais obstáculos em estudos com o cromossomo Y está relacionado justamente ao estado heterocromático desta estrutura, que em Drosophila melanogaster é formada por aproximadamente 41 Mb de sequências altamente repetitivas. Com aplicações em estudos citogenéticos, o protocolo para construção de sondas oligopaints não costuma incluir tais sequências. Considerando que existem apenas 1381 sondas para o cromossomo Y de D. melanogaster, enquanto que para seus outros cromossomos esse valor é ao menos dez vezes maior, oligopaints desta estrutura não permitem análises tão profundas quanto para os outros. Usando o cromossomo Y de D. melanogaster como modelo, este projeto objetiva identificar sequências repetitivas exclusivas do mesmo através do método YGS (Y chromosome Genome Scan), aumentando o número de sondas conhecidas para essa estrutura e permitindo construir seu oligopaint completo. Assim, sendo possível compilar as metodologias envolvidas para o desenvolvimento de uma nova técnica que possibilite construir oligopaints do cromossomo Y de qualquer espécie de interesse. A análise dos resultados e da própria eficiência e qualidade dos oligopaints obtidos será dada através da comparação direta entre estes e os gerados a partir das 1381 sondas atualmente conhecidas para o cromossomo Y. | |
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