Análise bayesiana de curvas de lactação de búfalos combinando informações genômicas e de pedigree

• Processo: 19/22136-8
• Modalidade de apoio: Bolsas no Exterior - Estágio de Pesquisa - Pós-Doutorado
• Data de Início da vigência: 01 de janeiro de 2020
• Data de Término da vigência: 31 de dezembro de 2020
• Área de conhecimento: Ciências Agrárias - Zootecnia - Genética e Melhoramento dos Animais Domésticos
• Pesquisador responsável: Humberto Tonhati
• Beneficiário: Sirlene Fernandes Lazaro
• Supervisor: Luiz Fernando Brito
• Instituição Sede: Faculdade de Ciências Agrárias e Veterinárias (FCAV). Universidade Estadual Paulista (UNESP). Campus de Jaboticabal. Jaboticabal , SP, Brasil
• Instituição Anfitriã: Purdue University, Estados Unidos
• Vinculado à bolsa: 17/23818-0 - Avaliação genômica de curvas de lactação em búfalos utilizando modelos bayesianos, BP.PD
• Assunto(s): Genômica Avaliação genética animal Lactação animal Búfalas Modelos estatísticos
• Palavra(s)-Chave do Pesquisador: hierarchical model | Non-linear model | wood | Genomica

Resumo

As curvas de lactação podem ser modeladas por diferentes funções matemáticas, que apresentam um número reduzido de parâmetros com interpretações biológicas. Assim, alterações desejáveis na forma das curvas podem ser obtidas ao considerar as estimativas destes parâmetros como observações fenotípicas em modelos estatísticos de avaliação genética. Dada a importância das informações genômicas, a utilização destes fenótipos pode ser expandida para modelos mais sofisticados, tais como os de Seleção e Associação Genômica Ampla. Portanto, este projeto objetiva avaliar a curva de lactação baseada na estrutura hierárquica bayesiana quanto à seleção e associação genômica ampla, por meio do uso de informações de genótipos e fenótipos, com ou sem as informações de pedigree; e identificar regiões cromossômicas e genes candidatos relacionados com os parâmetros da curva de lactação. Os dados serão de 12 fazendas participantes do programa de controle leiteiro do Departamento de Zootecnia da Universidade Estadual Paulista, campus de Jaboticabal-SP, com informações de, 4588 animais, nascidos entre 1971 e 2014. Foram genotipados 978 animais utilizando um painel de 90K Axiom® Buffalo Genotyping (Affymetrix). As observações de cinco características serão consideradas: produção de leite acumulada, porcentagem de gordura e proteína e produção de gordura e proteína. O modelo hierárquico bayesiano será aplicado primeiramente, para analisar a curva de lactação, posteriormente, os parâmetros da função serão modelados por modelos lineares multicaracterísticos e comparados através de suas capacidades preditivas por meio da validação cruzada, e assim verificar o melhor desempenho. (AU)

Publicações científicas

(Referências obtidas automaticamente do Web of Science e do SciELO, por meio da informação sobre o financiamento pela FAPESP e o número do processo correspondente, incluída na publicação pelos autores)

LAZARO, SIRLENE F.; TONHATI, HUMBERTO; OLIVEIRA, HINAYAH R.; SILVA, ALESSANDRA A.; NASCIMENTO, V, ANDRE; SANTOS, DANIEL J. A.; STEFANI, GABRIELA; BRITO, LUIZ F.. Genomic studies of milk-related traits in water buffalo (Bubalus bubalis) based on single-step genomic best linear unbiased prediction and random regression models. JOURNAL OF DAIRY SCIENCE, v. 104, n. 5, p. 5768-5793, MAY 2021. (17/23818-0, 19/22136-8)