Análise coarse-graining da interação entre vesículas lipídicas e peptídeos antimicrobianos e penetradores de células

• Processo: 19/26557-8
• Modalidade de apoio: Bolsas no Exterior - Estágio de Pesquisa - Doutorado Direto
• Data de Início da vigência: 22 de setembro de 2020
• Data de Término da vigência: 21 de setembro de 2021
• Área de conhecimento: Ciências Biológicas - Biofísica - Biofísica Molecular
• Pesquisador responsável: Iolanda Midea Cuccovia
• Beneficiário: Peter Park
• Supervisor: Siewert Jan Marrink
• Instituição Sede: Instituto de Química (IQ). Universidade de São Paulo (USP). São Paulo , SP, Brasil
• Instituição Anfitriã: University of Groningen, Holanda
• Vinculado à bolsa: 19/03023-8 - Como adentram a membrana os peptídeos penetradores de células?, BP.DD
• Assunto(s): Peptídeos catiônicos antimicrobianos Peptídeos penetradores de células Simulação de dinâmica molecular Membranas
• Palavra(s)-Chave do Pesquisador: antimicrobial peptides | Cell Penetrating Peptides | Coarse graining | membranes | molecular dynamics | Vesicles | Membranas

Resumo

Peptídeos catiônicos atuantes em membranas (CMAP) são protagonistas em diversos processos que envolvem membranas lipídicas como formação de poro, fusão de vesículas e ruptura. Dois grupos dos CMAP se destacam como potenciais fármacos inovadores ou como carreadores de fármacos. Peptídeos antimicrobianos (AMP) são uma classe promissora de agentes antimicrobianos e peptídeos penetradores de células (CPP) já estão em fase de teste para drug-delivery. Muitos AMP e CPP foram descobertos e tiveram suas estruturas secundárias analisadas em membranas modelo e testadas in vitro. Contudo, o seu mecanismo de ação exato ainda é obscuro, sendo um obstáculo para o uso dos CMAP na terapêutica. Simulações de Dinâmica Molecular podem fornecer informações atomísticas relevantes e têm sido utilizadas para muitos sistemas peptídeo/membrana, mas em proporções peptídeo/lipídeo baixas.Neste trabalho, propomos estudar o peptídeo TAT e BP100 em vesículas em concentrações crescentes dos peptídeos utilizando um modelo coarse-graining. As informações obtidas nos proverão informações cruciais acerca da agregação de peptídeos, forma da vesícula e o efeito dos peptídeos nas vesículas. Estas são informações que podem ser diretamente comparadas com dados experimentais de membranas modelo, permitindo uma descrição detalhada da ação de AMP e CPP em membranas. (AU)