Análise dos satelitomas de diferentes populações de Astyanax lacustris

• Processo: 19/24914-8
• Modalidade de apoio: Bolsas no Brasil - Iniciação Científica
• Data de Início da vigência: 01 de julho de 2020
• Data de Término da vigência: 31 de dezembro de 2021
• Área de conhecimento: Ciências Biológicas - Genética - Genética Animal
• Pesquisador responsável: Fábio Porto-Foresti
• Beneficiário: Rodrigo Milan Calegari
• Instituição Sede: Faculdade de Ciências (FC). Universidade Estadual Paulista (UNESP). Campus de Bauru. Bauru , SP, Brasil
• Assunto(s): Peixes neotropicais Biologia computacional DNA Genomas Astyanax Satélites Sequências repetitivas dispersas Análise de sequência de DNA
• Palavra(s)-Chave do Pesquisador: Astyanax | bioinformática | peixes neotropicais | satDNA | Satellitoma | DNAs repetitivos

Resumo

O estudo de sequências repetitivas foi bastante impactado pela popularização do sequenciamento de nova geração, juntamente com o desenvolvimento de novos scripts e softwares. Dentre estes, as coleções bioinformáticas como Reapeat Explorer e sat Miner têm reduzido o custo e o tempo das análises, permitindo um maior rendimento das análises. Os DNAs satélites (satDNAs) são sequências repetitivas in também e o catálogo completo deste tipo de sequência em uma determinada espécie é chamado de satelitoma. Em geral, os satDNAs não codificam algum produto funcional, sendo muitas vezes a sua função totalmente desconhecida no genoma. Nesse sentido, estas sequências estão sujeitas a uma rápida evolução, tornando os satelitomas de espécies próximas, bastante divergente. Nesse contexto, este estudo tem como objetivo caracterizar e comparar os satelitomas de diferentes populações de Astyanax lacustris, utilizando de ferramentas desenvolvidas com auxílio da bioinformática, com o intuito de melhor compreender os processos evolutivos pelos quais estão sujeitos às sequências repetitivas de DNA satélite no genoma de uma mesma espécie, encontradas em diferentes bacias.