Assinaturas genômicas de adaptação em Cereus (Cactaceae) na Diagonal Seca Brasileira

• Processo: 20/08998-4
• Modalidade de apoio: Bolsas no Brasil - Doutorado Direto
• Data de Início da vigência: 01 de agosto de 2020
• Data de Término da vigência: 31 de maio de 2021
• Área de conhecimento: Ciências Biológicas - Genética - Genética Vegetal
• Acordo de Cooperação: NSF - Dimensions of Biodiversity e BIOTA
• Pesquisador responsável: Evandro Marsola de Moraes
• Beneficiário: Danielle Bitencourt Araújo
• Instituição Sede: Centro de Ciências Humanas e Biológicas (CCHB). Universidade Federal de São Carlos (UFSCAR). Sorocaba , SP, Brasil
• Vinculado ao auxílio: 18/03428-5 - Dimensions US-BIOTA-Sao Paulo: características preditoras da diversificação adaptativa na Diagonal Seca Brasileira, AP.BTA.TEM
• Assunto(s): Filogenia Genômica Cactaceae Bioma Cerrado Seleção natural Amazônia Mata Atlântica América do Sul
• Palavra(s)-Chave do Pesquisador: Aprendizado de Máquina | cerrado | evolução molecular | Filogenia Comparada | Genômica | Seleção Natural | Filogenia e genômica

Resumo

A Diagonal Seca consiste em um corredor de biomas de formação aberta que separa a Floresta Amazônica e a Mata Atlântica na América do Sul. Apesar da grande biodiversidade, os mecanismos relacionados à especiação ecológica nesses ambientes xeromórficos ainda são pouco compreendidos. A exploração de dados genômicos em larga escala integrados com variações fenotípicas e ambientais tem sido uma estratégia potencial para a identificação de regiões envolvidas nos processos de adaptação a novos ambientes. Devido a estreita associação com ambientes secos, ampla distribuição na Diagonal Seca Brasileira e os eventos conhecidos de dispersão de suas linhagens, o gênero de cactos Cereus oferece uma oportunidade promissora para investigar o papel da seleção natural na diversificação e ocupação de diferentes habitats e biomas. O presente estudo visa identificar e caracterizar assinaturas genômicas de evolução adaptativa que possam estar relacionadas à colonização e permanência de linhagens de Cereus nos diferentes habitats e biomas da Diagonal Seca Brasileira. A abordagem adotada se apoiará na busca preditiva de características de importância adaptativa, sequenciamento, montagem e anotação de um genoma completo de referência para o gênero, resequenciamento de genoma completo e a detecção de variantes genéticas associadas a adaptação das linhagens irmãs a diferentes ambientes. (AU)