Conteúdo molecular, padrões de modificações epigenéticas e interferência dos cromossomos supranumerários em Drosophila melanogaster

• Processo: 20/06188-5
• Modalidade de apoio: Bolsas no Brasil - Doutorado
• Data de Início da vigência: 01 de dezembro de 2020
• Data de Término da vigência: 18 de janeiro de 2025
• Área de conhecimento: Ciências Biológicas - Genética - Genética Animal
• Pesquisador responsável: Diogo Cavalcanti Cabral de Mello
• Beneficiário: Ana Beatriz Stein Machado Ferretti
• Instituição Sede: Instituto de Biociências (IB). Universidade Estadual Paulista (UNESP). Campus de Rio Claro. Rio Claro , SP, Brasil
• Vinculado ao auxílio: 15/16661-1 - Cromossomos sexuais, cromossomos B e seus enigmas: sistemas modelo para estudos de evolução cromossômica e genômica, AP.TEM
• Bolsa(s) vinculada(s): 22/06509-1 - Os cromossomos B modificam os padrões de transcrição gênicos associados à elementos transponíveis na linhagem germinativa de Drosophila melanogaster?, BE.EP.DR
• Assunto(s): Cromossomos B Sequências repetitivas de ácido nucleico Drosophila Espermatogênese Drosophila melanogaster Epigênese genética
• Palavra(s)-Chave do Pesquisador: Cromossomos B | DNA repetitivo | Drosophila | espermatogênese | transcricao | Citogenética e genômica

Resumo

O conjunto de cromossomo essências aos indivíduos formam o completo A, quem incluem os cromossomos autossômicos e sexuais. Contudo, em várias espécies foi documentada a presença de cromossomos extras ou cromossomos B. Esses cromossomos não são parte essencial do genoma, mas já foi visto que sua presença pode causar alterações no metabolismo celular, alterando a expressão de genes. A presença de cromossomo B foi descrita na espécie Drosophila melanogaster há seis anos e considerando a quantidade de recursos e informações que se tem sobre esse organismo modelo, o estudo dos cromossomos B poderá ser aprofundado. Os estudos iniciais com esta espécie incluem descrições gerais sobre parte da composição do cromossomo B e sua provável origem. O cromossomo B é heterocromático em sua maior parte e foi visto que portadores desse cromossomo podem ser significantemente afetados em efeito de variegação, ficando claro que a presença o cromossomo B pode afetar a transcrição de loci genéticos sensíveis a aumento de heterocromatina. Nesse projeto, avançaremos em aspectos relativos à composição, evolução e funcionalidade dos cromossomos B em D. melanogaster. Para isso utilizaremos genomas sequenciados (0B e +B) para prospecção de DNAs repetitivos a serem utilizados em mapeamento cromossômico para entendimento da evolução e composição do cromossomo B. Os padrões de marcas epigenéticas dos cromossomos B serão estudados por análises com anticorpos contra fosforilação, acetilação, metilação e para RNA polimerase II que permitirão o entendimento da funcionalidade destes cromossomos em distintos tecidos. Finalmente a possível interferência dos cromossomos B na espermatogênese será testada por experimentos de RNAseq. Estes dados permitirão avanços sobre a biologia de cromossomos B na espécie que por ser um modelo em estudos genéticos e poderão ser extrapolados para outros organismos.

Publicações científicas

(Referências obtidas automaticamente do Web of Science e do SciELO, por meio da informação sobre o financiamento pela FAPESP e o número do processo correspondente, incluída na publicação pelos autores)

PEREIRA, JAQUELINE A.; MILANI, DIOGO; FERRETTI, ANA BEATRIZ S. M.; BARDELLA, VANESSA B.; CABRAL-DE-MELLO, DIOGO C.; LOPES, DENILCE M.. The extensive amplification of heterochromatin in Melipona bees revealed by high throughput genomic and chromosomal analysis. CHROMOSOMA, v. 130, n. 4, NOV 2021. (20/06188-5, 19/19069-7, 18/21772-5)

GASPAROTTO, ANA E.; MILANI, DIOGO; MARTI, EMILIANO; FERRETTI, ANA BEATRIZ S. M.; BARDELLA, VANESSA B.; HICKMANN, FREDERICO; ZRZAVA, MAGDA; MAREC, FRANTISEK; CABRAL-DE-MELLO, DIOGO C.. A step forward in the genome characterization of the sugarcane borer, Diatraea saccharalis: karyotype analysis, sex chromosome system and repetitive DNAs through a cytogenomic approach. CHROMOSOMA, v. 131, n. 4, p. 15-pg., 2022-10-11. (21/05908-7, 20/06188-5, 19/19069-7, 18/21772-5, 18/20351-6)