Criação de uma biblioteca de suporte para aplicações web customizadas para esfingolipídeos em câncer de cabeça e pescoço

• Processo: 21/03368-5
• Modalidade de apoio: Bolsas no Brasil - Iniciação Científica
• Data de Início da vigência: 01 de julho de 2021
• Data de Término da vigência: 30 de junho de 2022
• Área de conhecimento: Interdisciplinar
• Pesquisador responsável: Ricardo Roberto da Silva
• Beneficiário: Isabela do Amaral Griguol
• Instituição Sede: Faculdade de Ciências Farmacêuticas de Ribeirão Preto (FCFRP). Universidade de São Paulo (USP). Ribeirão Preto , SP, Brasil
• Vinculado ao auxílio: 17/18922-2 - Desenvolvimento de uma plataforma computacional modular extensível para análises de experimentos de metabolômica e metagenômica: inovando com a descoberta de novas atividades enzimáticas e produtos naturais de interesse farmacêutico derivados, AP.BTA.JP
• Assunto(s): Biologia computacional Neoplasias de cabeça e pescoço Quimioinformática Esfingolipídeos Lipidômica
• Palavra(s)-Chave do Pesquisador: bioinformática | câncer | Lipidômica | quimioinformática | Bioinformática

Resumo

Para exploração adequada dos padrões observados em experimentos de lipidômica é necessário um conhecimento avançado em múltiplas disciplinas. A colaboração multidisciplinar pode propiciar o desenvolvimento de aplicações que permitam a utilização pelo experimentalista, com foco na interpretação dos resultados e geração de hipóteses, enquanto o bioinformata foca na infraestrutura técnica, e nas pressuposições dos métodos de estatística computacional, para a escolha dos modelos mais adequados para responder às hipóteses de trabalho. Este projeto de iniciação científica tem como objetivo suportar a colaboração multidisciplinar entre o Laboratório de Marcadores e Sinalização Celular no Câncer (LMSCC) e o Laboratório de Quimio-Biologia Computacional (LQBC) no desenvolvimento de bibliotecas para aplicações web para análise de dados de lipidômica de amostras de cabeça e pescoço. Os laboratórios desenvolvem no momento a ferramenta pyLipids (http://seriema.fcfrp.usp.br:5030/lmscc/), uma aplicação web para análises de estatística uni e multivariada, o presente projeto objetiva expandir as funcionalidades da ferramenta, bem como melhorar a sua usabilidade, por meio da interação contínua com os alunos desenvolvendo os experimentos no LMSCC.